20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6363 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6363  SCP-like extracellular domain-containing protein  100 
 
 
327 aa  662    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18267  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1004  Allergen V5/Tpx-1 related  32.13 
 
 
382 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5104  Allergen V5/Tpx-1 related  26.18 
 
 
353 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217216  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1485  periplasmic protein  24.9 
 
 
459 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1632  putative periplasmic protein  30 
 
 
456 aa  54.3  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000262022  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4336  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.51 
 
 
352 aa  53.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253754  normal  0.853513 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2224  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.03 
 
 
358 aa  52  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  hitchhiker  0.00516568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3716  hypothetical protein  26.72 
 
 
310 aa  52  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1542  SCP-like extracellular  25 
 
 
327 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312767  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5207  SCP-like extracellular  25 
 
 
327 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5562  SCP-like extracellular  24.19 
 
 
340 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.249089 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3718  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.71 
 
 
319 aa  47.8  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.34 
 
 
455 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5022  SCP-like extracellular  22.55 
 
 
341 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0390932  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6555  SCP-like extracellular  23.44 
 
 
337 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5427  SCP-like extracellular  22.55 
 
 
341 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4607  Allergen V5/Tpx-1 related  28.7 
 
 
336 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398633  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2049  hypothetical protein  27.19 
 
 
466 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2680  SCP-like extracellular  23.88 
 
 
417 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473437  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4490  allergen V5/Tpx-1-like protein  22.97 
 
 
352 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>