19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2224 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2224  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 
358 aa  719    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  hitchhiker  0.00516568 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4336  Allergen V5/Tpx-1 family protein  49.71 
 
 
352 aa  288  8e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253754  normal  0.853513 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4490  allergen V5/Tpx-1-like protein  45.63 
 
 
352 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5207  SCP-like extracellular  34.04 
 
 
327 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1542  SCP-like extracellular  34.04 
 
 
327 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312767  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5427  SCP-like extracellular  32.66 
 
 
341 aa  109  6e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5022  SCP-like extracellular  32.68 
 
 
341 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0390932  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6555  SCP-like extracellular  31.55 
 
 
337 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5562  SCP-like extracellular  31.21 
 
 
340 aa  98.2  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.249089 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3718  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.77 
 
 
319 aa  89.4  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3673  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.07 
 
 
325 aa  88.6  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0308491  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3675  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.07 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5104  Allergen V5/Tpx-1 related  29.36 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217216  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1504  hypothetical protein  26.91 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.890142  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3716  hypothetical protein  31.31 
 
 
310 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4607  Allergen V5/Tpx-1 related  27.85 
 
 
336 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398633  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6363  SCP-like extracellular domain-containing protein  26.71 
 
 
327 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18267  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2049  hypothetical protein  26.23 
 
 
466 aa  43.1  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4392  SCP-like extracellular  29.22 
 
 
180 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>