20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3718 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3718  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 
319 aa  658    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3716  hypothetical protein  66.56 
 
 
310 aa  391  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3673  Allergen V5/Tpx-1 family protein  64.94 
 
 
325 aa  380  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0308491  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3675  Allergen V5/Tpx-1 family protein  65.55 
 
 
325 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4336  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.56 
 
 
352 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253754  normal  0.853513 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4490  allergen V5/Tpx-1-like protein  30.28 
 
 
352 aa  88.6  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5207  SCP-like extracellular  28.67 
 
 
327 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1542  SCP-like extracellular  28.67 
 
 
327 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312767  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2224  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.46 
 
 
358 aa  85.9  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  hitchhiker  0.00516568 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5104  Allergen V5/Tpx-1 related  28.32 
 
 
353 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217216  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5022  SCP-like extracellular  26.35 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0390932  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5562  SCP-like extracellular  28.87 
 
 
340 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.249089 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5427  SCP-like extracellular  26.01 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6555  SCP-like extracellular  28.52 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2049  hypothetical protein  32 
 
 
466 aa  58.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4607  Allergen V5/Tpx-1 related  25.29 
 
 
336 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398633  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1485  periplasmic protein  34.55 
 
 
459 aa  54.7  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1004  Allergen V5/Tpx-1 related  31.01 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6363  SCP-like extracellular domain-containing protein  25.09 
 
 
327 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18267  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  26.13 
 
 
287 aa  42.7  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>