19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1004 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1004  Allergen V5/Tpx-1 related  100 
 
 		 382 aa  764    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6363  SCP-like extracellular domain-containing protein  32.13 
 
 		 327 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18267  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5562  SCP-like extracellular  29.6 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.249089 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5022  SCP-like extracellular  27.34 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0390932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4490  allergen V5/Tpx-1-like protein  24.68 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4336  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.44 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253754  normal  0.853513 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1485  periplasmic protein  24.17 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5104  Allergen V5/Tpx-1 related  28.77 
 
 		 353 aa  64.3  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217216  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6555  SCP-like extracellular  25.27 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2049  hypothetical protein  24.25 
 
 		 466 aa  59.7  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5207  SCP-like extracellular  25.18 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1542  SCP-like extracellular  25.18 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5427  SCP-like extracellular  25 
 
 		 341 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4607  Allergen V5/Tpx-1 related  25.48 
 
 		 336 aa  53.5  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398633  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2680  SCP-like extracellular  24.23 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473437  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0639  SCP-like extracellular  25.36 
 
 		 283 aa  49.3  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  32.61 
 
 		 212 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3718  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.01 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1632  putative periplasmic protein  23.85 
 
 		 456 aa  43.5  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000262022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>