30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2049 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_2049  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  971    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1485  periplasmic protein  28.75 
 
 
459 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1632  putative periplasmic protein  27.27 
 
 
456 aa  138  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000262022  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5104  Allergen V5/Tpx-1 related  22.87 
 
 
353 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217216  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1004  Allergen V5/Tpx-1 related  24.25 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4490  allergen V5/Tpx-1-like protein  22.97 
 
 
352 aa  58.9  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3718  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32 
 
 
319 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3673  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.51 
 
 
325 aa  54.3  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0308491  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3675  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.51 
 
 
325 aa  54.3  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3716  hypothetical protein  31.97 
 
 
310 aa  52.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  29.23 
 
 
541 aa  50.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  29.73 
 
 
285 aa  50.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2043  Allergen V5/Tpx-1 related  28.82 
 
 
196 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0276422  normal  0.319002 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5005  SCP-like extracellular  27.87 
 
 
254 aa  49.7  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.342918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  27.43 
 
 
211 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  28.33 
 
 
244 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  28.85 
 
 
287 aa  48.5  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2270  SCP-like extracellular  29.46 
 
 
212 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00083862  normal  0.0734842 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2680  SCP-like extracellular  32.56 
 
 
417 aa  47.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473437  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0749  SCP-like extracellular  26.62 
 
 
355 aa  47.4  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0219  SCP-like extracellular  29.31 
 
 
495 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1289  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.68 
 
 
443 aa  46.6  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323784  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  29.41 
 
 
296 aa  46.6  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  26.27 
 
 
458 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5022  SCP-like extracellular  26.96 
 
 
341 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0390932  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5427  SCP-like extracellular  27.83 
 
 
341 aa  44.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4336  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.13 
 
 
352 aa  44.3  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253754  normal  0.853513 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4242  Allergen V5/Tpx-1 family protein  25.38 
 
 
444 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.152087 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38670  uncharacterized protein with SCP/PR1 domains  25.89 
 
 
260 aa  43.1  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  30.97 
 
 
450 aa  43.1  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>