21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5207 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1542  SCP-like extracellular  100 
 
 		 327 aa  648    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5207  SCP-like extracellular  100 
 
 		 327 aa  648    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5427  SCP-like extracellular  55.78 
 
 		 341 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5022  SCP-like extracellular  55.44 
 
 		 341 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0390932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6555  SCP-like extracellular  53.15 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5562  SCP-like extracellular  48.98 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.249089 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4490  allergen V5/Tpx-1-like protein  35.49 
 
 		 352 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2224  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.15 
 
 		 358 aa  125  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  hitchhiker  0.00516568 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4336  Allergen V5/Tpx-1 family protein  32.46 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253754  normal  0.853513 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3718  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.62 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5104  Allergen V5/Tpx-1 related  29.31 
 
 		 353 aa  85.9  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217216  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3675  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.51 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3716  hypothetical protein  27.84 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3673  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.18 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0308491  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1504  hypothetical protein  27.96 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.890142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1485  periplasmic protein  24.32 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1004  Allergen V5/Tpx-1 related  25.18 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4607  Allergen V5/Tpx-1 related  35.11 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398633  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1912  Allergen V5/Tpx-1 related  26.61 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6363  SCP-like extracellular domain-containing protein  25 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18267  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4285  SCP-like extracellular  29.57 
 
 		 296 aa  46.6  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>