24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5427 on replicon NC_012851
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012851  Rpic12D_5427  SCP-like extracellular  100 
 
 		 341 aa  669    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5022  SCP-like extracellular  99.12 
 
 		 341 aa  664    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0390932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6555  SCP-like extracellular  65.85 
 
 		 337 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5562  SCP-like extracellular  59.79 
 
 		 340 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.249089 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5207  SCP-like extracellular  56.51 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1542  SCP-like extracellular  56.51 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.312767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4336  Allergen V5/Tpx-1 family protein  30.36 
 
 		 352 aa  116  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253754  normal  0.853513 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4490  allergen V5/Tpx-1-like protein  29.94 
 
 		 352 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2224  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.72 
 
 		 358 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.449099  hitchhiker  0.00516568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3673  Allergen V5/Tpx-1 family protein  27.22 
 
 		 325 aa  82  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0308491  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3675  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.71 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.119335  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3716  hypothetical protein  25.95 
 
 		 310 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1504  hypothetical protein  25 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.890142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3718  Allergen V5/Tpx-1 family protein  26.14 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1004  Allergen V5/Tpx-1 related  26.97 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1485  periplasmic protein  33.33 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5104  Allergen V5/Tpx-1 related  26.85 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217216  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4607  Allergen V5/Tpx-1 related  25.71 
 
 		 336 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0398633  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3504  Allergen V5/Tpx-1 family protein  24.07 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0613  SCP-like extracellular  22.71 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.170655  normal  0.096585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1912  Allergen V5/Tpx-1 related  29.41 
 
 		 264 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1632  putative periplasmic protein  23.91 
 
 		 456 aa  46.2  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000262022  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2049  hypothetical protein  27.83 
 
 		 466 aa  44.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6363  SCP-like extracellular domain-containing protein  35 
 
 		 327 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18267  normal  0.482727 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>