17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0613 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0613  SCP-like extracellular  100 
 
 
329 aa  668    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.170655  normal  0.096585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3504  Allergen V5/Tpx-1 family protein  74.46 
 
 
331 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0639  SCP-like extracellular  62.65 
 
 
283 aa  320  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  66.09 
 
 
455 aa  311  1e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  62.92 
 
 
457 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2680  SCP-like extracellular  25.09 
 
 
417 aa  60.1  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3299  SCP-like extracellular  33.33 
 
 
342 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000136792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  30.95 
 
 
347 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  30.84 
 
 
244 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5427  SCP-like extracellular  23.08 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5022  SCP-like extracellular  23.08 
 
 
341 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0390932  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  35.85 
 
 
287 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4591  Allergen V5/Tpx-1 family protein  24.56 
 
 
213 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.39255  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1188  hypothetical protein  25.42 
 
 
263 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0215059  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1485  periplasmic protein  24.83 
 
 
459 aa  43.1  0.006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4672  SCP-like extracellular  29.91 
 
 
458 aa  42.7  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.988125  normal  0.181044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  32.35 
 
 
211 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>