18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3504 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3504  Allergen V5/Tpx-1 family protein  100 
 
 		 331 aa  674    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0613  SCP-like extracellular  74.46 
 
 		 329 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.170655  normal  0.096585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0639  SCP-like extracellular  62.36 
 
 		 283 aa  332  5e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  64.38 
 
 		 455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  55.59 
 
 		 457 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5022  SCP-like extracellular  24.07 
 
 		 341 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0390932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5427  SCP-like extracellular  24.07 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2680  SCP-like extracellular  24.91 
 
 		 417 aa  53.5  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473437  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  28.22 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3299  SCP-like extracellular  31.53 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000136792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2237  SCP-like extracellular  32.08 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1940  SCP-like extracellular  26.21 
 
 		 242 aa  46.6  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0764504  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0728  SCP-like extracellular  28.83 
 
 		 285 aa  46.6  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0851  hypothetical protein  32.67 
 
 		 287 aa  46.6  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.721637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5290  SCP-like extracellular  29.25 
 
 		 211 aa  46.2  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3687  SCP-like extracellular  26.52 
 
 		 167 aa  45.8  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00687212  normal  0.48067 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3565  hypothetical protein  30.77 
 
 		 206 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.727767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8056  hypothetical protein  26.67 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>