27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1632 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1632  putative periplasmic protein  100 
 
 
456 aa  937    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000262022  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1485  periplasmic protein  41.74 
 
 
459 aa  330  3e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2049  hypothetical protein  27.27 
 
 
466 aa  138  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.670502  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2680  SCP-like extracellular  24.44 
 
 
417 aa  63.5  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473437  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3384  Allergen V5/Tpx-1-like  31.78 
 
 
294 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4336  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.28 
 
 
352 aa  53.5  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.253754  normal  0.853513 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3579  hypothetical protein  28.68 
 
 
293 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38499  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49660  hypothetical protein  27.13 
 
 
282 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5562  SCP-like extracellular  22.89 
 
 
340 aa  50.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.249089 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6363  SCP-like extracellular domain-containing protein  30 
 
 
327 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18267  normal  0.482727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2482  SCP-like extracellular  28.36 
 
 
283 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.897986  normal  0.230524 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5427  SCP-like extracellular  23.91 
 
 
341 aa  47.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5022  SCP-like extracellular  23.91 
 
 
341 aa  47.4  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0390932  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1543  hypothetical protein  28.57 
 
 
235 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6555  SCP-like extracellular  21.83 
 
 
337 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3169  Allergen V5/Tpx-1 family protein  25.95 
 
 
279 aa  45.8  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.635999  normal  0.126682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18350  hypothetical protein  27.13 
 
 
301 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4238  hypothetical protein  28.21 
 
 
282 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3350  Allergen V5/Tpx-1 related  28.57 
 
 
293 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688686  normal  0.0178942 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001041  hypothetical protein  22.22 
 
 
179 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2358  SCP-like extracellular  28.7 
 
 
283 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678269  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2649  hypothetical protein  28.57 
 
 
320 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4490  allergen V5/Tpx-1-like protein  24.41 
 
 
352 aa  44.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1004  Allergen V5/Tpx-1 related  23.85 
 
 
382 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5104  Allergen V5/Tpx-1 related  24.85 
 
 
353 aa  43.9  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.217216  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1426  SCP-like extracellular protein  31.78 
 
 
287 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000767316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1399  SCP-like extracellular  31.78 
 
 
287 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000144066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>