124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0391 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0391  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  696    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1732  hypothetical protein  53.37 
 
 		 372 aa  305  7e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  normal  0.994205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1466  hypothetical protein  44.05 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7037  hypothetical protein  39.77 
 
 		 389 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5926  hypothetical protein  42.39 
 
 		 358 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.768295 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0917  hypothetical protein  41.9 
 
 		 358 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  31.25 
 
 		 520 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  33.87 
 
 		 518 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  31.78 
 
 		 519 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 		 518 aa  170  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  31.79 
 
 		 525 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  31.72 
 
 		 521 aa  160  4e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  31.09 
 
 		 530 aa  159  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  34.41 
 
 		 533 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4549  hypothetical protein  32.72 
 
 		 516 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954799  normal  0.0134652 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4416  hypothetical protein  32.72 
 
 		 516 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  34.48 
 
 		 482 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  33.85 
 
 		 509 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  36.95 
 
 		 518 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3608  hypothetical protein  38.46 
 
 		 338 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  31.53 
 
 		 527 aa  152  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  32.27 
 
 		 551 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  29.93 
 
 		 502 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  30.69 
 
 		 520 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  29.3 
 
 		 533 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  30.45 
 
 		 516 aa  148  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  31.44 
 
 		 533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  30.36 
 
 		 520 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  29.07 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  30.74 
 
 		 518 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  29.21 
 
 		 518 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0423  conserved hypothetical gluconokinase  27.95 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  30.03 
 
 		 520 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  30.09 
 
 		 532 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  29.15 
 
 		 520 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  30.84 
 
 		 520 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  33.88 
 
 		 504 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  28.15 
 
 		 556 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  29.97 
 
 		 512 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2257  hypothetical protein  36.33 
 
 		 584 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  hitchhiker  0.00613294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1074  hypothetical protein  34.84 
 
 		 523 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1090  hypothetical protein  34.84 
 
 		 523 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  32.18 
 
 		 498 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1101  hypothetical protein  34.84 
 
 		 523 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0319349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6932  hypothetical protein  34.38 
 
 		 523 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1384  hypothetical protein  34.81 
 
 		 490 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.112089  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  31.58 
 
 		 517 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  29.04 
 
 		 518 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  31.78 
 
 		 520 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  31.48 
 
 		 544 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  28.39 
 
 		 540 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  28.57 
 
 		 520 aa  134  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2056  hypothetical protein  29 
 
 		 510 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  32.89 
 
 		 506 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  28.57 
 
 		 520 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  28.84 
 
 		 527 aa  132  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  31.61 
 
 		 508 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  30.07 
 
 		 508 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  33.45 
 
 		 497 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  32.89 
 
 		 513 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  28.67 
 
 		 523 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  33.1 
 
 		 514 aa  130  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6936  hypothetical protein  35.89 
 
 		 494 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441597  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13151  hypothetical protein  32.26 
 
 		 556 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.309836 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  29.15 
 
 		 522 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  32.79 
 
 		 509 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  31.82 
 
 		 523 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  31.94 
 
 		 523 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  34.4 
 
 		 533 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  30.54 
 
 		 529 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  28.57 
 
 		 526 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  34.46 
 
 		 490 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  30.46 
 
 		 516 aa  124  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3305  hypothetical protein  30.25 
 
 		 537 aa  123  5e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  32.65 
 
 		 535 aa  122  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  29.84 
 
 		 528 aa  122  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  30.69 
 
 		 509 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  33.22 
 
 		 525 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  30.25 
 
 		 520 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12036  hypothetical protein  29.66 
 
 		 498 aa  120  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1868  hypothetical protein  29.49 
 
 		 549 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2984  hypothetical protein  31.83 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  22.93 
 
 		 513 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  22.93 
 
 		 513 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3252  hypothetical protein  37.6 
 
 		 534 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0668  hypothetical protein  35.02 
 
 		 544 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  23.57 
 
 		 504 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4063  hypothetical protein  30.79 
 
 		 575 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0148  hypothetical protein  28.62 
 
 		 514 aa  110  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  31.21 
 
 		 579 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2122  hypothetical protein  31.85 
 
 		 505 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46200  hypothetical protein  33.21 
 
 		 336 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2266  hypothetical protein  23.91 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0470  hypothetical protein  32.28 
 
 		 505 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  31.95 
 
 		 526 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  31.6 
 
 		 524 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5756  hypothetical protein  29.62 
 
 		 518 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2603  hypothetical protein  29.49 
 
 		 542 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  30.43 
 
 		 547 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1915  hypothetical protein  28.62 
 
 		 526 aa  101  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>