123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2984 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2984  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  690    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954869  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  47.84 
 
 
524 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  48.03 
 
 
526 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2603  hypothetical protein  42.21 
 
 
542 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28783  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4549  hypothetical protein  40.85 
 
 
516 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954799  normal  0.0134652 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4416  hypothetical protein  40.85 
 
 
516 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768574  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  40.89 
 
 
514 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0668  hypothetical protein  40.59 
 
 
544 aa  184  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2221  hypothetical protein  39.08 
 
 
520 aa  182  7e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  38.87 
 
 
547 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4721  hypothetical protein  38.73 
 
 
519 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358451  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  37.1 
 
 
509 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0661  aminoglycoside phosphotransferase  41.97 
 
 
515 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0314986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4047  hypothetical protein  37.58 
 
 
526 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237674  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1915  hypothetical protein  36.54 
 
 
526 aa  176  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294472  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  39.07 
 
 
523 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  40.33 
 
 
528 aa  169  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  35.8 
 
 
518 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1349  hypothetical protein  39.1 
 
 
521 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  38.67 
 
 
523 aa  165  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6097  hypothetical protein  41.71 
 
 
509 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2056  hypothetical protein  33.68 
 
 
510 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46200  hypothetical protein  42.42 
 
 
336 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0470  hypothetical protein  37.65 
 
 
505 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2122  hypothetical protein  37.35 
 
 
505 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  34.26 
 
 
502 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3997  aminoglycoside phosphotransferase  34.63 
 
 
489 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219665  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2058  hypothetical protein  40.57 
 
 
447 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5756  hypothetical protein  37.02 
 
 
518 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  39.15 
 
 
497 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  38.44 
 
 
498 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  36.09 
 
 
520 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  33.95 
 
 
533 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  37.63 
 
 
508 aa  154  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  37.05 
 
 
540 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  35.48 
 
 
518 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  33.9 
 
 
523 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  35.4 
 
 
520 aa  153  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  35.15 
 
 
516 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  35.46 
 
 
521 aa  152  8e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  34.54 
 
 
533 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  37.63 
 
 
527 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  36.11 
 
 
526 aa  152  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  37.02 
 
 
506 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  38.49 
 
 
513 aa  151  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  34.04 
 
 
520 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  33.66 
 
 
530 aa  151  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  35.2 
 
 
556 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  31.38 
 
 
504 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  34.71 
 
 
520 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2613  hypothetical protein  38.34 
 
 
512 aa  150  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.209456  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2392  kinase-like protein  38.41 
 
 
505 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42432  normal  0.238047 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  35.21 
 
 
517 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  34.64 
 
 
512 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  40.98 
 
 
482 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  36.27 
 
 
504 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  33.57 
 
 
519 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3305  hypothetical protein  37.22 
 
 
537 aa  146  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  29.36 
 
 
513 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  29.36 
 
 
513 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  32.26 
 
 
508 aa  144  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  34.04 
 
 
520 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  34.52 
 
 
518 aa  144  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  35.54 
 
 
509 aa  142  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  34.74 
 
 
551 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  33.21 
 
 
518 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  35.19 
 
 
579 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  33.64 
 
 
520 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  37.12 
 
 
544 aa  135  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  33.82 
 
 
509 aa  135  9e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  35.25 
 
 
535 aa  135  9e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  30.94 
 
 
525 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  34.11 
 
 
518 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0148  hypothetical protein  31.96 
 
 
514 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  29.9 
 
 
520 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5926  hypothetical protein  34.17 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.768295 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  34.18 
 
 
499 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  35.64 
 
 
516 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  34.06 
 
 
532 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  34 
 
 
518 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  34.98 
 
 
520 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1868  hypothetical protein  34.15 
 
 
549 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299085  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0917  hypothetical protein  33.45 
 
 
358 aa  126  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1732  hypothetical protein  33.94 
 
 
372 aa  125  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  normal  0.994205 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  29.7 
 
 
522 aa  122  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  32.41 
 
 
533 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1424  hypothetical protein  35.4 
 
 
569 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3211  hypothetical protein  35.4 
 
 
603 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3085  hypothetical protein  35.4 
 
 
603 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1466  hypothetical protein  33.99 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  28.62 
 
 
520 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2028  hypothetical protein  35.05 
 
 
600 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2266  hypothetical protein  28.87 
 
 
338 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157441  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1052  hypothetical protein  35.05 
 
 
600 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1338  hypothetical protein  35.05 
 
 
600 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2318  hypothetical protein  35.05 
 
 
600 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469586  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  29.6 
 
 
520 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7037  hypothetical protein  31.65 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0423  conserved hypothetical gluconokinase  26.26 
 
 
325 aa  120  4.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6936  hypothetical protein  35.54 
 
 
494 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441597  normal  0.226555 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>