123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1466 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1466  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  689    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0917  hypothetical protein  49.54 
 
 		 358 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5926  hypothetical protein  51.48 
 
 		 358 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.768295 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1732  hypothetical protein  49.85 
 
 		 372 aa  268  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  normal  0.994205 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7037  hypothetical protein  43.9 
 
 		 389 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0391  hypothetical protein  45.1 
 
 		 345 aa  243  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  37.41 
 
 		 520 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  37.54 
 
 		 520 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  36.39 
 
 		 520 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  36.39 
 
 		 520 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  34.97 
 
 		 519 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  37.75 
 
 		 518 aa  182  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  34.14 
 
 		 518 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  37.2 
 
 		 525 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  38.98 
 
 		 518 aa  178  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3608  hypothetical protein  41.75 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  36.09 
 
 		 520 aa  172  9e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  34.52 
 
 		 518 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  34.25 
 
 		 533 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  35.88 
 
 		 529 aa  169  6e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  34.52 
 
 		 556 aa  169  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  34.73 
 
 		 502 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  36.42 
 
 		 520 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  35.02 
 
 		 527 aa  168  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  36.81 
 
 		 509 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  32.03 
 
 		 523 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  34.43 
 
 		 551 aa  166  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  33.64 
 
 		 520 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  34.14 
 
 		 518 aa  166  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  34.85 
 
 		 533 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  35.69 
 
 		 516 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  32.32 
 
 		 520 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  32.8 
 
 		 530 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  36.04 
 
 		 544 aa  164  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  32.04 
 
 		 540 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  33.23 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  31.33 
 
 		 504 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  31.4 
 
 		 516 aa  160  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  36.05 
 
 		 533 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  34.41 
 
 		 527 aa  155  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  33.13 
 
 		 526 aa  154  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  33.77 
 
 		 520 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  33.33 
 
 		 517 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  33 
 
 		 508 aa  154  2.9999999999999998e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  31.23 
 
 		 518 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4549  hypothetical protein  34.2 
 
 		 516 aa  153  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954799  normal  0.0134652 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4416  hypothetical protein  34.2 
 
 		 516 aa  153  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  29.13 
 
 		 513 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  29.13 
 
 		 513 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  32 
 
 		 522 aa  152  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2056  hypothetical protein  31.83 
 
 		 510 aa  151  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  33.23 
 
 		 532 aa  151  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6932  hypothetical protein  37.41 
 
 		 523 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  35.44 
 
 		 525 aa  149  8e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  34.81 
 
 		 504 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2266  hypothetical protein  27.95 
 
 		 338 aa  147  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2257  hypothetical protein  35.01 
 
 		 584 aa  146  5e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  hitchhiker  0.00613294 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  34.31 
 
 		 520 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  33.44 
 
 		 521 aa  144  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0423  conserved hypothetical gluconokinase  29.27 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6936  hypothetical protein  35.24 
 
 		 494 aa  142  8e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441597  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  38.08 
 
 		 533 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2984  hypothetical protein  33.99 
 
 		 345 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  33.56 
 
 		 497 aa  137  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12036  hypothetical protein  34.8 
 
 		 498 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  33.11 
 
 		 513 aa  136  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  32.64 
 
 		 506 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  35.14 
 
 		 523 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1868  hypothetical protein  32.71 
 
 		 549 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  34.04 
 
 		 509 aa  135  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3305  hypothetical protein  33.63 
 
 		 537 aa  135  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0148  hypothetical protein  30.84 
 
 		 514 aa  134  1.9999999999999998e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1074  hypothetical protein  35.69 
 
 		 523 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1090  hypothetical protein  35.69 
 
 		 523 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1101  hypothetical protein  35.69 
 
 		 523 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0319349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  36.14 
 
 		 482 aa  132  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  30.53 
 
 		 509 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  31.73 
 
 		 508 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  33.67 
 
 		 490 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  33.33 
 
 		 579 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  34.42 
 
 		 523 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  32.81 
 
 		 514 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4063  hypothetical protein  33.43 
 
 		 575 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2603  hypothetical protein  30.67 
 
 		 542 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  32.82 
 
 		 528 aa  126  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  32.81 
 
 		 526 aa  126  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13151  hypothetical protein  31.77 
 
 		 556 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.309836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  31.99 
 
 		 524 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1384  hypothetical protein  33.09 
 
 		 490 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.112089  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  32.34 
 
 		 520 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  34.05 
 
 		 498 aa  123  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1424  hypothetical protein  35.91 
 
 		 569 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3085  hypothetical protein  35.91 
 
 		 603 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46200  hypothetical protein  32.3 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3211  hypothetical protein  35.57 
 
 		 603 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2028  hypothetical protein  35.23 
 
 		 600 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1052  hypothetical protein  35.23 
 
 		 600 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1338  hypothetical protein  35.23 
 
 		 600 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2318  hypothetical protein  35.23 
 
 		 600 aa  119  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469586  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2314  hypothetical protein  34.98 
 
 		 613 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>