130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6936 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6936  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  966    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441597  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6932  hypothetical protein  55.33 
 
 		 523 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3252  hypothetical protein  52.85 
 
 		 534 aa  412  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2257  hypothetical protein  53.88 
 
 		 584 aa  398  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  hitchhiker  0.00613294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4063  hypothetical protein  52.75 
 
 		 575 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  48.54 
 
 		 533 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1970  hypothetical protein  47.36 
 
 		 529 aa  345  7e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.971424  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  50.24 
 
 		 533 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  42.79 
 
 		 490 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1074  hypothetical protein  43.86 
 
 		 523 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1090  hypothetical protein  43.86 
 
 		 523 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1101  hypothetical protein  43.86 
 
 		 523 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0319349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12036  hypothetical protein  39.32 
 
 		 498 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1384  hypothetical protein  41.63 
 
 		 490 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.112089  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  37.85 
 
 		 527 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  36.88 
 
 		 518 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  34.24 
 
 		 525 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  37.95 
 
 		 518 aa  207  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  31.05 
 
 		 520 aa  206  5e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  35.96 
 
 		 518 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  33.79 
 
 		 519 aa  205  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  35.29 
 
 		 517 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  34.38 
 
 		 521 aa  194  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2056  hypothetical protein  28.47 
 
 		 510 aa  192  9e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  31.69 
 
 		 518 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  31.66 
 
 		 518 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  28.02 
 
 		 513 aa  192  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  28.25 
 
 		 513 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  27.73 
 
 		 504 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  33.8 
 
 		 529 aa  187  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  29.62 
 
 		 523 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  32.43 
 
 		 533 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  30.95 
 
 		 512 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  33.63 
 
 		 525 aa  184  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  31.47 
 
 		 502 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  31.21 
 
 		 520 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  30.75 
 
 		 520 aa  180  4e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  31.36 
 
 		 520 aa  181  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  30.48 
 
 		 556 aa  180  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  30.84 
 
 		 520 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  29.16 
 
 		 508 aa  176  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  30.39 
 
 		 520 aa  176  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  30.61 
 
 		 520 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  29.71 
 
 		 551 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  29.66 
 
 		 520 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  32.86 
 
 		 509 aa  171  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  34.57 
 
 		 509 aa  171  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  30.07 
 
 		 540 aa  170  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  30.66 
 
 		 518 aa  170  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  30.32 
 
 		 526 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  32.21 
 
 		 504 aa  167  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  32.92 
 
 		 508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  31.87 
 
 		 520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  33.41 
 
 		 520 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  28.33 
 
 		 527 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  30.63 
 
 		 533 aa  162  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4549  hypothetical protein  33.16 
 
 		 516 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954799  normal  0.0134652 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4416  hypothetical protein  33.16 
 
 		 516 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  27.54 
 
 		 530 aa  160  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  32.71 
 
 		 516 aa  159  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  31.19 
 
 		 513 aa  157  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  30.37 
 
 		 497 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  32.34 
 
 		 514 aa  154  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  29.14 
 
 		 520 aa  153  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  32.79 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  27.31 
 
 		 516 aa  152  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  28.23 
 
 		 532 aa  149  8e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  33.18 
 
 		 523 aa  149  8e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  30.67 
 
 		 509 aa  148  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0148  hypothetical protein  30.1 
 
 		 514 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  31.93 
 
 		 498 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  38.32 
 
 		 526 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0423  conserved hypothetical gluconokinase  26.69 
 
 		 325 aa  145  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  29.86 
 
 		 482 aa  144  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  37.72 
 
 		 524 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  29.47 
 
 		 506 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  26.48 
 
 		 522 aa  138  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  32.94 
 
 		 544 aa  138  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2266  hypothetical protein  29.62 
 
 		 338 aa  137  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1466  hypothetical protein  34.78 
 
 		 345 aa  136  9e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1868  hypothetical protein  32.06 
 
 		 549 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0661  aminoglycoside phosphotransferase  30.1 
 
 		 515 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0314986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3305  hypothetical protein  33.67 
 
 		 537 aa  133  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  30.84 
 
 		 528 aa  133  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0668  hypothetical protein  29.46 
 
 		 544 aa  133  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  29.83 
 
 		 499 aa  133  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  31.94 
 
 		 535 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0391  hypothetical protein  35.89 
 
 		 345 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4047  hypothetical protein  29.92 
 
 		 526 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5926  hypothetical protein  36.31 
 
 		 358 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.768295 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0917  hypothetical protein  33.33 
 
 		 358 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13151  hypothetical protein  31 
 
 		 556 aa  123  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.309836 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1915  hypothetical protein  29.18 
 
 		 526 aa  123  8e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294472  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1732  hypothetical protein  35.67 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  normal  0.994205 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2603  hypothetical protein  33.01 
 
 		 542 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6097  hypothetical protein  34.13 
 
 		 509 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4721  hypothetical protein  27.75 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358451  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2984  hypothetical protein  35.54 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  28.1 
 
 		 547 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3211  hypothetical protein  32.06 
 
 		 603 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>