127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1090 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1074  hypothetical protein  100 
 
 
523 aa  1053    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1090  hypothetical protein  100 
 
 
523 aa  1053    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1101  hypothetical protein  100 
 
 
523 aa  1053    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0319349  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  58.91 
 
 
490 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1384  hypothetical protein  58.16 
 
 
490 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.112089  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12036  hypothetical protein  52.85 
 
 
498 aa  462  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  47.71 
 
 
533 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  47.38 
 
 
533 aa  350  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2257  hypothetical protein  41.7 
 
 
584 aa  309  8e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  hitchhiker  0.00613294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6932  hypothetical protein  39.83 
 
 
523 aa  298  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6936  hypothetical protein  44.36 
 
 
494 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441597  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4063  hypothetical protein  40.26 
 
 
575 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3252  hypothetical protein  39.83 
 
 
534 aa  250  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1970  hypothetical protein  37.4 
 
 
529 aa  239  9e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.971424  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  32.68 
 
 
527 aa  219  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  33.26 
 
 
525 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2056  hypothetical protein  29.8 
 
 
510 aa  209  8e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  27.29 
 
 
520 aa  209  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  30.82 
 
 
520 aa  205  1e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  30.04 
 
 
520 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  30.1 
 
 
525 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  30.09 
 
 
523 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  32.89 
 
 
529 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  29.83 
 
 
520 aa  204  3e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  33.33 
 
 
518 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  31.82 
 
 
518 aa  200  6e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  32.45 
 
 
521 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  29.74 
 
 
508 aa  192  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  31.33 
 
 
502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  28.79 
 
 
504 aa  189  9e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  33.26 
 
 
544 aa  188  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  29.78 
 
 
520 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  32.68 
 
 
518 aa  186  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  30.85 
 
 
533 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  28.57 
 
 
513 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  30.06 
 
 
520 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  28.57 
 
 
513 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  31.46 
 
 
508 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  26.91 
 
 
519 aa  179  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  29.15 
 
 
527 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  30.29 
 
 
518 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  31.18 
 
 
526 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  32.75 
 
 
482 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  30.61 
 
 
509 aa  177  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  32.24 
 
 
514 aa  176  8e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  30.69 
 
 
497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  28.61 
 
 
518 aa  173  7.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  32.9 
 
 
498 aa  173  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  30.42 
 
 
513 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  29.61 
 
 
520 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  31.43 
 
 
517 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  28.54 
 
 
522 aa  171  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  30.65 
 
 
518 aa  170  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  29.61 
 
 
551 aa  169  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  30.45 
 
 
504 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  31.86 
 
 
526 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  31.94 
 
 
533 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  31.82 
 
 
524 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  27.84 
 
 
516 aa  164  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  30.07 
 
 
520 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  33.89 
 
 
579 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  28.18 
 
 
540 aa  162  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  31.87 
 
 
509 aa  162  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1868  hypothetical protein  30.97 
 
 
549 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299085  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  30.23 
 
 
520 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  29.23 
 
 
512 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0148  hypothetical protein  28.54 
 
 
514 aa  159  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  31.19 
 
 
506 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  29.31 
 
 
520 aa  156  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  26.97 
 
 
530 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  31.56 
 
 
520 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  30.27 
 
 
516 aa  153  7e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4549  hypothetical protein  30.02 
 
 
516 aa  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954799  normal  0.0134652 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4416  hypothetical protein  30.02 
 
 
516 aa  153  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768574  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  28.89 
 
 
556 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2603  hypothetical protein  30.57 
 
 
542 aa  150  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28783  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0661  aminoglycoside phosphotransferase  30.33 
 
 
515 aa  146  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0314986 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  29.92 
 
 
528 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  31.51 
 
 
535 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  30.23 
 
 
509 aa  144  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3305  hypothetical protein  29.96 
 
 
537 aa  143  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0391  hypothetical protein  34.84 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2392  kinase-like protein  32.27 
 
 
505 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42432  normal  0.238047 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  28.29 
 
 
547 aa  140  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  30.15 
 
 
523 aa  139  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2221  hypothetical protein  30.73 
 
 
520 aa  139  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  29.96 
 
 
499 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0470  hypothetical protein  32.11 
 
 
505 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3211  hypothetical protein  31.41 
 
 
603 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1915  hypothetical protein  27.39 
 
 
526 aa  137  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294472  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  29.29 
 
 
523 aa  136  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1466  hypothetical protein  35.19 
 
 
345 aa  136  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2028  hypothetical protein  30.4 
 
 
600 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1052  hypothetical protein  30.4 
 
 
600 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1338  hypothetical protein  30.4 
 
 
600 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2318  hypothetical protein  30.4 
 
 
600 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469586  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6097  hypothetical protein  31.75 
 
 
509 aa  134  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1424  hypothetical protein  30.65 
 
 
569 aa  133  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3085  hypothetical protein  30.65 
 
 
603 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2613  hypothetical protein  30.31 
 
 
512 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.209456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>