124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2257 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2257  hypothetical protein  100 
 
 		 584 aa  1151    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  hitchhiker  0.00613294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6932  hypothetical protein  52.26 
 
 		 523 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1970  hypothetical protein  51.33 
 
 		 529 aa  457  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.971424  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4063  hypothetical protein  47.64 
 
 		 575 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  46.52 
 
 		 533 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6936  hypothetical protein  56.85 
 
 		 494 aa  384  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441597  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  47.27 
 
 		 533 aa  343  4e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  39.6 
 
 		 490 aa  291  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1074  hypothetical protein  40.34 
 
 		 523 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1090  hypothetical protein  40.34 
 
 		 523 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1101  hypothetical protein  40.34 
 
 		 523 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0319349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1384  hypothetical protein  39.39 
 
 		 490 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.112089  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3252  hypothetical protein  51.2 
 
 		 534 aa  271  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12036  hypothetical protein  35.52 
 
 		 498 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  32.15 
 
 		 527 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  30 
 
 		 519 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  31.39 
 
 		 529 aa  220  7e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  38.2 
 
 		 518 aa  220  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  37.8 
 
 		 518 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  31.65 
 
 		 520 aa  211  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  29.82 
 
 		 520 aa  208  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  40.42 
 
 		 518 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  32.11 
 
 		 513 aa  201  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  27.12 
 
 		 520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  27.92 
 
 		 523 aa  196  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  31.93 
 
 		 521 aa  195  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  29.7 
 
 		 520 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  27.88 
 
 		 527 aa  190  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  28.22 
 
 		 520 aa  190  7e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  29.44 
 
 		 520 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  33.42 
 
 		 525 aa  186  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  32.64 
 
 		 508 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  29.47 
 
 		 518 aa  184  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  31.03 
 
 		 525 aa  182  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  29.06 
 
 		 520 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  28.89 
 
 		 502 aa  181  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  28.76 
 
 		 533 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  34.62 
 
 		 517 aa  180  8e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  28.68 
 
 		 551 aa  179  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2056  hypothetical protein  30.16 
 
 		 510 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  28.29 
 
 		 518 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  27.75 
 
 		 520 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  30.02 
 
 		 544 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  29.21 
 
 		 526 aa  173  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  28.1 
 
 		 516 aa  172  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  30.33 
 
 		 523 aa  172  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  32.98 
 
 		 518 aa  170  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  30.9 
 
 		 520 aa  170  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  29.89 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  30 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  29.67 
 
 		 513 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  30.66 
 
 		 530 aa  167  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13151  hypothetical protein  29.64 
 
 		 556 aa  167  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.309836 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  29.67 
 
 		 513 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  30.23 
 
 		 520 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  28.41 
 
 		 532 aa  164  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  29.43 
 
 		 522 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  30.71 
 
 		 508 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  28.84 
 
 		 504 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  28.04 
 
 		 556 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  29.31 
 
 		 506 aa  159  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  31.74 
 
 		 482 aa  159  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  33.7 
 
 		 520 aa  157  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  28.74 
 
 		 523 aa  157  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  32.07 
 
 		 540 aa  156  8e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  30.94 
 
 		 504 aa  156  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  28.41 
 
 		 497 aa  153  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1868  hypothetical protein  33.72 
 
 		 549 aa  153  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  27.68 
 
 		 512 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  33.6 
 
 		 509 aa  152  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  32.12 
 
 		 509 aa  151  3e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  33.52 
 
 		 535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  28.52 
 
 		 516 aa  147  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  30.3 
 
 		 514 aa  145  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  33.68 
 
 		 498 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  34.14 
 
 		 526 aa  144  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4549  hypothetical protein  32.96 
 
 		 516 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954799  normal  0.0134652 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4416  hypothetical protein  32.96 
 
 		 516 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0148  hypothetical protein  30.08 
 
 		 514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  34.15 
 
 		 524 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1466  hypothetical protein  35.86 
 
 		 345 aa  140  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0391  hypothetical protein  36.33 
 
 		 345 aa  139  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  32.54 
 
 		 528 aa  138  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2613  hypothetical protein  34.16 
 
 		 512 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.209456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5756  hypothetical protein  31.23 
 
 		 518 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  32.22 
 
 		 499 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  27.39 
 
 		 579 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0661  aminoglycoside phosphotransferase  34.18 
 
 		 515 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0314986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2603  hypothetical protein  30.43 
 
 		 542 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0917  hypothetical protein  33.75 
 
 		 358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0423  conserved hypothetical gluconokinase  26.37 
 
 		 325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  32.22 
 
 		 547 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2221  hypothetical protein  32.39 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1732  hypothetical protein  33.74 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  normal  0.994205 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5926  hypothetical protein  34.8 
 
 		 358 aa  125  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.768295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0668  hypothetical protein  27.66 
 
 		 544 aa  124  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3305  hypothetical protein  30.15 
 
 		 537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1915  hypothetical protein  30.83 
 
 		 526 aa  120  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294472  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2266  hypothetical protein  29.21 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4721  hypothetical protein  31.28 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>