124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4063 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4063  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1135    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6932  hypothetical protein  60.83 
 
 		 523 aa  621  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2257  hypothetical protein  52.11 
 
 		 584 aa  456  1e-127  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  hitchhiker  0.00613294 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6936  hypothetical protein  52.97 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441597  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1970  hypothetical protein  50.85 
 
 		 529 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.971424  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  42.72 
 
 		 533 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3252  hypothetical protein  44.42 
 
 		 534 aa  316  6e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  47.11 
 
 		 533 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  41.8 
 
 		 490 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12036  hypothetical protein  38.48 
 
 		 498 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1074  hypothetical protein  40.26 
 
 		 523 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1090  hypothetical protein  40.26 
 
 		 523 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1101  hypothetical protein  40.26 
 
 		 523 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0319349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1384  hypothetical protein  40.09 
 
 		 490 aa  233  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.112089  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  35.55 
 
 		 527 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  33.93 
 
 		 529 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  31.39 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  33.77 
 
 		 525 aa  196  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  31 
 
 		 519 aa  195  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  31.06 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  31.45 
 
 		 520 aa  194  5e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  30.84 
 
 		 520 aa  192  2e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  34.96 
 
 		 518 aa  189  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  31.95 
 
 		 525 aa  187  7e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  30.4 
 
 		 521 aa  184  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  32.84 
 
 		 517 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  31.8 
 
 		 518 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  29.98 
 
 		 551 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  32.38 
 
 		 498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  26.15 
 
 		 523 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  30.35 
 
 		 518 aa  164  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  33.26 
 
 		 513 aa  163  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  29.22 
 
 		 518 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  27.13 
 
 		 513 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  29.67 
 
 		 520 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  26.86 
 
 		 513 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  31.36 
 
 		 509 aa  159  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2056  hypothetical protein  26.29 
 
 		 510 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  30.11 
 
 		 520 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  31.58 
 
 		 482 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  30.85 
 
 		 544 aa  157  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  34.02 
 
 		 526 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  32.29 
 
 		 508 aa  155  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  26.46 
 
 		 530 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  28.76 
 
 		 556 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  26.94 
 
 		 522 aa  154  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  32 
 
 		 523 aa  153  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  33.06 
 
 		 524 aa  153  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  28.42 
 
 		 532 aa  151  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  27.43 
 
 		 518 aa  150  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  31.78 
 
 		 523 aa  150  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  27.74 
 
 		 533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  29.41 
 
 		 520 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  29.72 
 
 		 504 aa  148  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  28.08 
 
 		 512 aa  147  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  27.81 
 
 		 527 aa  146  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  27.33 
 
 		 502 aa  146  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13151  hypothetical protein  29.92 
 
 		 556 aa  146  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.309836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  28.48 
 
 		 520 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  29.89 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  30.16 
 
 		 509 aa  145  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  25.93 
 
 		 504 aa  145  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  26.97 
 
 		 516 aa  145  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  29.78 
 
 		 509 aa  144  6e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  29.8 
 
 		 520 aa  143  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  27.25 
 
 		 520 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  27.15 
 
 		 508 aa  142  9.999999999999999e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  27.04 
 
 		 540 aa  140  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  30.41 
 
 		 535 aa  138  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  27.19 
 
 		 518 aa  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  30.68 
 
 		 499 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  29 
 
 		 520 aa  137  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1868  hypothetical protein  34.83 
 
 		 549 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4721  hypothetical protein  30.5 
 
 		 519 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358451  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4549  hypothetical protein  35.59 
 
 		 516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954799  normal  0.0134652 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  29.6 
 
 		 526 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4416  hypothetical protein  35.59 
 
 		 516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  30.26 
 
 		 528 aa  131  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  28.54 
 
 		 516 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5756  hypothetical protein  28.45 
 
 		 518 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2613  hypothetical protein  31.97 
 
 		 512 aa  128  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.209456  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  29.61 
 
 		 497 aa  127  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1466  hypothetical protein  33.43 
 
 		 345 aa  127  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  28.12 
 
 		 506 aa  126  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  28.29 
 
 		 514 aa  126  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1732  hypothetical protein  35.37 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  normal  0.994205 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  30.28 
 
 		 547 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0661  aminoglycoside phosphotransferase  29.8 
 
 		 515 aa  124  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0314986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4047  hypothetical protein  28.25 
 
 		 526 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1349  hypothetical protein  31.26 
 
 		 521 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2221  hypothetical protein  30.09 
 
 		 520 aa  117  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0470  hypothetical protein  30.79 
 
 		 505 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0917  hypothetical protein  32.08 
 
 		 358 aa  114  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2266  hypothetical protein  25.16 
 
 		 338 aa  114  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2122  hypothetical protein  31.72 
 
 		 505 aa  114  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  29.02 
 
 		 579 aa  114  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0391  hypothetical protein  30.79 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1915  hypothetical protein  26.81 
 
 		 526 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294472  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2058  hypothetical protein  30.59 
 
 		 447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0148  hypothetical protein  28.76 
 
 		 514 aa  111  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79926 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>