122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3608 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3608  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1732  hypothetical protein  41.25 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  normal  0.994205 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5926  hypothetical protein  38.8 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.768295 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7037  hypothetical protein  37.5 
 
 		 389 aa  164  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1466  hypothetical protein  41.75 
 
 		 345 aa  160  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0917  hypothetical protein  38.14 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0391  hypothetical protein  38.46 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  33.44 
 
 		 518 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  30.1 
 
 		 518 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  27.04 
 
 		 520 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  29.13 
 
 		 518 aa  119  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  28.1 
 
 		 520 aa  113  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  29.93 
 
 		 521 aa  113  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  27.45 
 
 		 520 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  34.54 
 
 		 523 aa  109  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  28.15 
 
 		 527 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  29.13 
 
 		 525 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  29.89 
 
 		 523 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  31.9 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  26.77 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  29.83 
 
 		 517 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  29.87 
 
 		 527 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  25.34 
 
 		 519 aa  106  7e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6936  hypothetical protein  32.87 
 
 		 494 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441597  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  27 
 
 		 513 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  31.16 
 
 		 529 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  27 
 
 		 513 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  30.55 
 
 		 526 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2056  hypothetical protein  28.1 
 
 		 510 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6932  hypothetical protein  31.88 
 
 		 523 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  34.14 
 
 		 523 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  32.8 
 
 		 547 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1349  hypothetical protein  33.33 
 
 		 521 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0661  aminoglycoside phosphotransferase  35.62 
 
 		 515 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0314986 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1868  hypothetical protein  32.65 
 
 		 549 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  30.96 
 
 		 509 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  28.97 
 
 		 518 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  33.69 
 
 		 513 aa  98.6  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  29.64 
 
 		 514 aa  98.6  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  32.28 
 
 		 533 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  28.81 
 
 		 512 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  24.16 
 
 		 504 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  29.51 
 
 		 556 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  32.92 
 
 		 526 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  32.19 
 
 		 508 aa  96.7  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  27.81 
 
 		 502 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  32.92 
 
 		 524 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2257  hypothetical protein  31.75 
 
 		 584 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  hitchhiker  0.00613294 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  25.41 
 
 		 518 aa  95.1  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  33.75 
 
 		 520 aa  95.5  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  32.08 
 
 		 504 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4549  hypothetical protein  32.6 
 
 		 516 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954799  normal  0.0134652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  31.14 
 
 		 520 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4416  hypothetical protein  32.6 
 
 		 516 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  31.15 
 
 		 528 aa  94  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  32.03 
 
 		 544 aa  93.6  5e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  30.07 
 
 		 520 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  27.95 
 
 		 520 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  27.48 
 
 		 533 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  25.46 
 
 		 540 aa  90.5  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  28.28 
 
 		 520 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2984  hypothetical protein  29.43 
 
 		 345 aa  90.1  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  33.56 
 
 		 535 aa  90.1  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  28.11 
 
 		 520 aa  89.4  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  27.59 
 
 		 506 aa  89  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2266  hypothetical protein  23.76 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.157441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  27.36 
 
 		 530 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2613  hypothetical protein  34.55 
 
 		 512 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.209456  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4047  hypothetical protein  33.04 
 
 		 526 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4063  hypothetical protein  31.29 
 
 		 575 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  27.69 
 
 		 518 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0470  hypothetical protein  35.81 
 
 		 505 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  31.71 
 
 		 497 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2122  hypothetical protein  35.53 
 
 		 505 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  31.05 
 
 		 499 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  25.35 
 
 		 516 aa  87.8  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  30.14 
 
 		 533 aa  87  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  27.97 
 
 		 516 aa  86.7  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  28.57 
 
 		 525 aa  86.3  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1424  hypothetical protein  33.07 
 
 		 569 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1915  hypothetical protein  33.02 
 
 		 526 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294472  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3085  hypothetical protein  33.07 
 
 		 603 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  28.88 
 
 		 579 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  25.84 
 
 		 508 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  28.47 
 
 		 509 aa  84.3  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  27.53 
 
 		 551 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0423  conserved hypothetical gluconokinase  20.49 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46200  hypothetical protein  33.47 
 
 		 336 aa  84.3  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5756  hypothetical protein  30.19 
 
 		 518 aa  84.3  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  24.01 
 
 		 522 aa  83.6  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0668  hypothetical protein  31.65 
 
 		 544 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3252  hypothetical protein  35.69 
 
 		 534 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2603  hypothetical protein  31.47 
 
 		 542 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28783  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2028  hypothetical protein  32.67 
 
 		 600 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1052  hypothetical protein  32.67 
 
 		 600 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1338  hypothetical protein  32.67 
 
 		 600 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3211  hypothetical protein  32.67 
 
 		 603 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2318  hypothetical protein  32.67 
 
 		 600 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469586  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  33.73 
 
 		 482 aa  82.8  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4721  hypothetical protein  32.03 
 
 		 519 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358451  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>