36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05227 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  85.6 
 
 		 243 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  75.72 
 
 		 243 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  74.07 
 
 		 243 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  74.07 
 
 		 243 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  57.56 
 
 		 238 aa  275  5e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  56.6 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  48.4 
 
 		 222 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  42 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  40.32 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  40.87 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  39.53 
 
 		 275 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  39.13 
 
 		 275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  39.21 
 
 		 275 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  40.66 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0042  hypothetical protein  40 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3623  hypothetical protein  39.72 
 
 		 243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  38.33 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  37 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0119  hypothetical protein  73.02 
 
 		 99 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  32.52 
 
 		 273 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4770  hypothetical protein  30.8 
 
 		 261 aa  89  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573385  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  31.17 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4610  hypothetical protein  30.71 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  28.57 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  29.46 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1200  hypothetical protein  28.23 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173646  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1990  hypothetical protein  27.54 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.694197  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1879  hypothetical protein  27.54 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1975  hypothetical protein  28.93 
 
 		 283 aa  73.9  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0438  hypothetical protein  33.05 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  27.56 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  27.04 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4107  hypothetical protein  26.45 
 
 		 275 aa  69.3  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0349  hypothetical protein  28.81 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1889  hypothetical protein  31.18 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.269802  hitchhiker  0.000253515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>