27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3623 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3623  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0042  hypothetical protein  85.6 
 
 
243 aa  424  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  40.38 
 
 
241 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  39.72 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  38.32 
 
 
243 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  37.85 
 
 
243 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  37.85 
 
 
243 aa  148  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  37.38 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  37.44 
 
 
238 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  35.29 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  31.98 
 
 
258 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  29.84 
 
 
275 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  29.17 
 
 
252 aa  99  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  33.16 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3620  hypothetical protein  74.65 
 
 
97 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.567327  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  30.35 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  28.93 
 
 
275 aa  95.1  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  26.84 
 
 
275 aa  90.1  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  28.92 
 
 
245 aa  88.6  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  28.14 
 
 
245 aa  80.5  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  25.45 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0119  hypothetical protein  38.57 
 
 
99 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  25.33 
 
 
273 aa  49.3  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4816  hypothetical protein  47.06 
 
 
55 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847444  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  24.86 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  23.64 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1889  hypothetical protein  26.42 
 
 
193 aa  42  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.269802  hitchhiker  0.000253515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>