35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0934 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  508  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  95.24 
 
 
275 aa  487  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  95.24 
 
 
275 aa  489  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  86.9 
 
 
252 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  80.95 
 
 
258 aa  416  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  68.65 
 
 
252 aa  356  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  46.28 
 
 
275 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  44.63 
 
 
245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  40.48 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  40.48 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  40.66 
 
 
248 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  43.21 
 
 
245 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  38.89 
 
 
243 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  39.17 
 
 
243 aa  155  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  42.67 
 
 
222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  39.42 
 
 
238 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  38.58 
 
 
241 aa  122  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3623  hypothetical protein  29.17 
 
 
243 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  33.93 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1200  hypothetical protein  34.22 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173646  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0042  hypothetical protein  28.8 
 
 
243 aa  92  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4107  hypothetical protein  33.94 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193766  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  31.08 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  34.62 
 
 
273 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  30.8 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4770  hypothetical protein  34.27 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573385  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4610  hypothetical protein  33.19 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  32.86 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  32.85 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0438  hypothetical protein  32.74 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1975  hypothetical protein  28.81 
 
 
283 aa  63.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0349  hypothetical protein  31.58 
 
 
261 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1990  hypothetical protein  29.35 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.694197  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1879  hypothetical protein  28.86 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0119  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>