35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2403 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  556  1e-157  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  96.73 
 
 		 275 aa  541  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  95.24 
 
 		 252 aa  487  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  88.1 
 
 		 252 aa  454  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  80.54 
 
 		 258 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  68.65 
 
 		 252 aa  360  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  44.4 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  40.08 
 
 		 243 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  40.08 
 
 		 243 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  46.35 
 
 		 245 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  39.53 
 
 		 248 aa  166  5e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  38.49 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  43.39 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  37.94 
 
 		 243 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  42.22 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  39.83 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  39.09 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3623  hypothetical protein  29.84 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1200  hypothetical protein  34.22 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  32.89 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0042  hypothetical protein  29.32 
 
 		 243 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  31.98 
 
 		 273 aa  85.5  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4107  hypothetical protein  34.08 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4770  hypothetical protein  34.58 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573385  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4610  hypothetical protein  33.62 
 
 		 283 aa  78.6  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  30.8 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  34.31 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  32.86 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1975  hypothetical protein  28.91 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0438  hypothetical protein  34.53 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  33 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0349  hypothetical protein  30.43 
 
 		 261 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1990  hypothetical protein  28.5 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.694197  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1879  hypothetical protein  28 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0119  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>