34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6590 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  553  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  82.05 
 
 		 273 aa  454  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1975  hypothetical protein  42.76 
 
 		 283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4770  hypothetical protein  40.43 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573385  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0438  hypothetical protein  41.76 
 
 		 262 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4610  hypothetical protein  41.49 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4107  hypothetical protein  38.01 
 
 		 275 aa  165  8e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  36.5 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0349  hypothetical protein  38.25 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1200  hypothetical protein  34.07 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  33.33 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  34.72 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  31.85 
 
 		 255 aa  118  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1879  hypothetical protein  28.25 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1990  hypothetical protein  26.69 
 
 		 262 aa  99.4  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.694197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1889  hypothetical protein  32.42 
 
 		 193 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.269802  hitchhiker  0.000253515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  34.48 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  29.57 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  29.57 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  34.87 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  28.51 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  31.17 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  34.62 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  30.43 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  34.31 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  33.5 
 
 		 275 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  31.12 
 
 		 245 aa  72  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  32.94 
 
 		 275 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  30.17 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  32 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  26.97 
 
 		 241 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  30.36 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  26.09 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0042  hypothetical protein  23.81 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>