26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1889 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1889  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  396  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.269802  hitchhiker  0.000253515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0349  hypothetical protein  66.49 
 
 		 261 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0438  hypothetical protein  35.94 
 
 		 262 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1975  hypothetical protein  32.35 
 
 		 283 aa  99.4  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4770  hypothetical protein  32.63 
 
 		 261 aa  94.4  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573385  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4610  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  94  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  32.42 
 
 		 273 aa  85.1  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  32.42 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  29.65 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1990  hypothetical protein  33.15 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.694197  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1879  hypothetical protein  33.15 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1200  hypothetical protein  27.5 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173646  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4107  hypothetical protein  30.2 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  26.5 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  27.41 
 
 		 255 aa  57.8  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  28.65 
 
 		 258 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  30.54 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  29.79 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  31.18 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  29.94 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  29.94 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  27.68 
 
 		 245 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  29.41 
 
 		 275 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  26.14 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3623  hypothetical protein  26.42 
 
 		 243 aa  42  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  25.58 
 
 		 245 aa  41.2  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>