33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1200 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1200  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  566  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  87.64 
 
 
276 aa  493  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  63.53 
 
 
255 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  39.34 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4770  hypothetical protein  38.02 
 
 
261 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573385  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  35.69 
 
 
273 aa  158  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4107  hypothetical protein  34.2 
 
 
275 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193766  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0438  hypothetical protein  34.6 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  34.07 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  34.44 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4610  hypothetical protein  32.74 
 
 
283 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1975  hypothetical protein  32.17 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0349  hypothetical protein  32.33 
 
 
261 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1879  hypothetical protein  28.63 
 
 
262 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1990  hypothetical protein  28.63 
 
 
262 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.694197  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  34.36 
 
 
252 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  32.31 
 
 
258 aa  97.8  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  34.22 
 
 
275 aa  95.9  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  35.47 
 
 
252 aa  95.5  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  34.22 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  91.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  29.8 
 
 
275 aa  86.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  30.95 
 
 
243 aa  85.5  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  30.95 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  30.95 
 
 
243 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  29.19 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  28.23 
 
 
248 aa  75.5  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  29.91 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  29.11 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1889  hypothetical protein  27.5 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.269802  hitchhiker  0.000253515 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  28.22 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  27.8 
 
 
241 aa  62  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  25.12 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>