35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1563 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  510  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  68.65 
 
 		 275 aa  360  9e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  68.25 
 
 		 275 aa  358  5e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  68.65 
 
 		 252 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  66.27 
 
 		 252 aa  347  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  65.08 
 
 		 258 aa  337  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  42 
 
 		 248 aa  182  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  42.97 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  42.97 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  46.31 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  41.91 
 
 		 243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  42.17 
 
 		 243 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  45.16 
 
 		 275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  44.67 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  44.29 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  40.08 
 
 		 238 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  36.86 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1200  hypothetical protein  34.36 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  33.85 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3623  hypothetical protein  33.16 
 
 		 243 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0042  hypothetical protein  31.61 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4770  hypothetical protein  35.19 
 
 		 261 aa  92.4  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573385  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  33.95 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4610  hypothetical protein  32.68 
 
 		 283 aa  89  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4107  hypothetical protein  35.45 
 
 		 275 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0438  hypothetical protein  35.85 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1975  hypothetical protein  32.33 
 
 		 283 aa  85.9  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  32.57 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  34.87 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  34.43 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  35.2 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0349  hypothetical protein  31.43 
 
 		 261 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1879  hypothetical protein  31.35 
 
 		 262 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1990  hypothetical protein  31.35 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.694197  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0119  hypothetical protein  50 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>