35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2177 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  559  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  96.73 
 
 		 275 aa  541  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  95.24 
 
 		 252 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  87.7 
 
 		 252 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  80.54 
 
 		 258 aa  429  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  68.25 
 
 		 252 aa  358  6e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  43.66 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  40.08 
 
 		 243 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  40.08 
 
 		 243 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  45.26 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  39.13 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  38.49 
 
 		 243 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  42.98 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  37.15 
 
 		 243 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  40.81 
 
 		 222 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  39.42 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  36.6 
 
 		 241 aa  122  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3623  hypothetical protein  28.93 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  30.61 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1200  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173646  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0042  hypothetical protein  29.53 
 
 		 243 aa  89.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  31.53 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4107  hypothetical protein  33.63 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  30.8 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4770  hypothetical protein  33.94 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573385  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  33.5 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4610  hypothetical protein  32.76 
 
 		 283 aa  72.4  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  32.86 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0438  hypothetical protein  34.08 
 
 		 262 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1975  hypothetical protein  27.56 
 
 		 283 aa  62.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  32.51 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0349  hypothetical protein  30.04 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1990  hypothetical protein  28.5 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.694197  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1879  hypothetical protein  28 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0119  hypothetical protein  40 
 
 		 99 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>