35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2870 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  88.1 
 
 		 275 aa  454  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  87.7 
 
 		 275 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  86.9 
 
 		 252 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  80.16 
 
 		 258 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  66.27 
 
 		 252 aa  347  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  40.32 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  40.87 
 
 		 243 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  40.87 
 
 		 243 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  39.29 
 
 		 243 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  45.04 
 
 		 275 aa  167  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  38.1 
 
 		 243 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  43.98 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  42.32 
 
 		 245 aa  158  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  39.42 
 
 		 238 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  41.26 
 
 		 222 aa  148  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  37.91 
 
 		 241 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3623  hypothetical protein  30.35 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1200  hypothetical protein  35.47 
 
 		 273 aa  95.5  6e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173646  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0042  hypothetical protein  30.73 
 
 		 243 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  32.51 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4770  hypothetical protein  31.73 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573385  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  31.67 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  34.48 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4107  hypothetical protein  32.88 
 
 		 275 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  34.11 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0438  hypothetical protein  34.74 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1975  hypothetical protein  30.36 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  34.23 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0349  hypothetical protein  32.11 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4610  hypothetical protein  31.3 
 
 		 283 aa  76.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  31.98 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1879  hypothetical protein  28.5 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1990  hypothetical protein  29 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.694197  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0119  hypothetical protein  40.35 
 
 		 99 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>