33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1975 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1975  hypothetical protein  100 
 
 		 283 aa  577  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4610  hypothetical protein  57.5 
 
 		 283 aa  323  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4770  hypothetical protein  56.03 
 
 		 261 aa  317  1e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573385  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0438  hypothetical protein  54.26 
 
 		 262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4107  hypothetical protein  41.13 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  40.21 
 
 		 273 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  42.76 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  41.99 
 
 		 273 aa  195  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0349  hypothetical protein  39.11 
 
 		 261 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  35.46 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1200  hypothetical protein  32.17 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  32.38 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  32.03 
 
 		 255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1990  hypothetical protein  28.47 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.694197  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1879  hypothetical protein  28.83 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1889  hypothetical protein  32.35 
 
 		 193 aa  99.4  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.269802  hitchhiker  0.000253515 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  33.08 
 
 		 275 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  31.56 
 
 		 245 aa  89  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  30.5 
 
 		 245 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  32.33 
 
 		 252 aa  85.9  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  30.36 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  29.63 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  29.63 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  28.93 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  28.81 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  28.91 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  28.22 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  28.81 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  27.56 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  28.75 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  25.32 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  23.53 
 
 		 241 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  24.9 
 
 		 238 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>