37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0905 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  497  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  497  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  96.71 
 
 
243 aa  484  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  74.07 
 
 
248 aa  375  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  74.07 
 
 
243 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  56.07 
 
 
238 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  55.56 
 
 
241 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  46.12 
 
 
222 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  42.97 
 
 
252 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  40.87 
 
 
252 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  42.06 
 
 
258 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  40.08 
 
 
275 aa  168  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  40.08 
 
 
275 aa  166  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  40.48 
 
 
252 aa  162  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  39.91 
 
 
275 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3623  hypothetical protein  37.85 
 
 
243 aa  148  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0042  hypothetical protein  36.74 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  38.16 
 
 
245 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  38.16 
 
 
245 aa  139  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4770  hypothetical protein  29.24 
 
 
261 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573385  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  30.77 
 
 
273 aa  89.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4610  hypothetical protein  29.64 
 
 
283 aa  86.3  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  30.14 
 
 
276 aa  85.1  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0119  hypothetical protein  70.18 
 
 
99 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1200  hypothetical protein  30.95 
 
 
273 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173646  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  29.57 
 
 
273 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  28.51 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  32.35 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0438  hypothetical protein  30 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4107  hypothetical protein  26.45 
 
 
275 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193766  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1975  hypothetical protein  29.63 
 
 
283 aa  75.1  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  29.06 
 
 
258 aa  72.8  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0349  hypothetical protein  30.45 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1990  hypothetical protein  25 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.694197  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1879  hypothetical protein  25.42 
 
 
262 aa  67  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1889  hypothetical protein  29.94 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.269802  hitchhiker  0.000253515 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5453  hypothetical protein  35.56 
 
 
205 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.468294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>