35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1079 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  526  1e-149  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1200  hypothetical protein  39.34 
 
 
273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  38.28 
 
 
276 aa  176  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4610  hypothetical protein  38.35 
 
 
283 aa  164  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0438  hypothetical protein  38.93 
 
 
262 aa  158  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  37.94 
 
 
255 aa  158  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4770  hypothetical protein  37.85 
 
 
261 aa  151  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573385  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1975  hypothetical protein  35.46 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4107  hypothetical protein  37.55 
 
 
275 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193766  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  32.2 
 
 
273 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  34.83 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  34.72 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0349  hypothetical protein  35.41 
 
 
261 aa  126  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1879  hypothetical protein  29.07 
 
 
262 aa  118  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1990  hypothetical protein  28.52 
 
 
262 aa  112  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.694197  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  31.91 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  31.91 
 
 
245 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  30.93 
 
 
245 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  34.43 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  34.11 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  29.06 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  29.06 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  32.86 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  32.71 
 
 
258 aa  72  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  27.04 
 
 
248 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  32.86 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  28.33 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  32.86 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  28.95 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  25.83 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3623  hypothetical protein  25.45 
 
 
243 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  27.51 
 
 
241 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  26.51 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0042  hypothetical protein  25.12 
 
 
243 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1889  hypothetical protein  28.65 
 
 
193 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.269802  hitchhiker  0.000253515 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>