35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0251 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  57.56 
 
 
248 aa  275  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  55.88 
 
 
243 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  55.65 
 
 
243 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  56.07 
 
 
243 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  56.07 
 
 
243 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  52.84 
 
 
241 aa  239  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  40.08 
 
 
252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  40.64 
 
 
222 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  41.22 
 
 
258 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  39.42 
 
 
252 aa  149  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  39.83 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  39.42 
 
 
275 aa  144  9e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  39.42 
 
 
252 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  35.47 
 
 
245 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0042  hypothetical protein  37.56 
 
 
243 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  36.75 
 
 
275 aa  141  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  36.32 
 
 
245 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3623  hypothetical protein  37.44 
 
 
243 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0119  hypothetical protein  48.57 
 
 
99 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  27.49 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4770  hypothetical protein  27.75 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573385  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1200  hypothetical protein  25.12 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173646  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4107  hypothetical protein  26.82 
 
 
275 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193766  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0349  hypothetical protein  29.02 
 
 
261 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  26.7 
 
 
273 aa  58.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0438  hypothetical protein  30.28 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  26.51 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  26.09 
 
 
273 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  28.02 
 
 
255 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  26.55 
 
 
273 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4610  hypothetical protein  24.8 
 
 
283 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1990  hypothetical protein  23.5 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.694197  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1879  hypothetical protein  24.65 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1975  hypothetical protein  24.9 
 
 
283 aa  49.7  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>