19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0119 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0119  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  204  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  73.02 
 
 
248 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  71.43 
 
 
243 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  71.93 
 
 
243 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  70.18 
 
 
243 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  70.18 
 
 
243 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  48.57 
 
 
238 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  41.43 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  50 
 
 
252 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3623  hypothetical protein  38.57 
 
 
243 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0042  hypothetical protein  37.14 
 
 
243 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  41.82 
 
 
258 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  40.35 
 
 
252 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  40 
 
 
252 aa  47  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  40 
 
 
275 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  40 
 
 
275 aa  46.6  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  36.23 
 
 
275 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  36.23 
 
 
245 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  36.23 
 
 
245 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>