36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1561 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  84.9 
 
 		 245 aa  421  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  83.67 
 
 		 245 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  46.88 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  45.16 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  44.4 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  43.66 
 
 		 275 aa  176  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  46.28 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  45.04 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  39.21 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  37.89 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  39.91 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  39.91 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  38.6 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  42.65 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  36.75 
 
 		 238 aa  141  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  35.07 
 
 		 241 aa  118  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0042  hypothetical protein  27.6 
 
 		 243 aa  95.5  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  31.91 
 
 		 258 aa  93.2  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1975  hypothetical protein  33.08 
 
 		 283 aa  90.5  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3623  hypothetical protein  26.84 
 
 		 243 aa  90.1  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  30.04 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1200  hypothetical protein  29.8 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173646  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  31.33 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  28.98 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4770  hypothetical protein  27.31 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573385  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0438  hypothetical protein  31.12 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4107  hypothetical protein  29.96 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4610  hypothetical protein  27.59 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1990  hypothetical protein  26.29 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.694197  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  31.95 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  32.94 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1879  hypothetical protein  26.29 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0349  hypothetical protein  27.11 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1889  hypothetical protein  29.41 
 
 		 193 aa  49.3  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.269802  hitchhiker  0.000253515 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0119  hypothetical protein  36.23 
 
 		 99 aa  45.8  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>