27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0042 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0042  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3623  hypothetical protein  85.6 
 
 
243 aa  424  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  40 
 
 
248 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  40.67 
 
 
241 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  38.6 
 
 
243 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  36.74 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  36.74 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  36.28 
 
 
243 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  37.56 
 
 
238 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  33.68 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3620  hypothetical protein  78.87 
 
 
97 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.567327  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  31.73 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  31.61 
 
 
252 aa  96.3  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  27.6 
 
 
275 aa  95.5  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  30.73 
 
 
252 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  29.32 
 
 
275 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  28.08 
 
 
245 aa  92.4  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  28.8 
 
 
252 aa  92  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  29.53 
 
 
275 aa  89.4  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  28.64 
 
 
245 aa  85.9  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  25.12 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4816  hypothetical protein  49.02 
 
 
55 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.847444  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0119  hypothetical protein  37.14 
 
 
99 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  25.79 
 
 
273 aa  46.2  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  25.37 
 
 
273 aa  45.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  23.81 
 
 
273 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  24.1 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>