33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0438 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0438  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1975  hypothetical protein  54.26 
 
 
283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4770  hypothetical protein  54.62 
 
 
261 aa  278  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573385  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4610  hypothetical protein  48.75 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4107  hypothetical protein  44.19 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193766  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0349  hypothetical protein  43.87 
 
 
261 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  41.7 
 
 
273 aa  195  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  42.16 
 
 
273 aa  191  7e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  41.76 
 
 
273 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  38.93 
 
 
258 aa  158  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1200  hypothetical protein  34.6 
 
 
273 aa  148  9e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  35.21 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  32.95 
 
 
255 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1879  hypothetical protein  28.85 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1990  hypothetical protein  28.57 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.694197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1889  hypothetical protein  35.94 
 
 
193 aa  102  5e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.269802  hitchhiker  0.000253515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  35.85 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  31.12 
 
 
275 aa  79.7  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  30 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  30 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  28.75 
 
 
245 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  34.74 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  29.54 
 
 
243 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  33.05 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  29.91 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  29.75 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  34.53 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  34.08 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  32.74 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  31.34 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  30.71 
 
 
222 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  30.28 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  26.34 
 
 
241 aa  45.4  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>