33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4107 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4107  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.193766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1965  hypothetical protein  61.17 
 
 		 273 aa  345  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1975  hypothetical protein  41.13 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4610  hypothetical protein  44.88 
 
 		 283 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0438  hypothetical protein  44.19 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102174  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4770  hypothetical protein  41.35 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.573385  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3365  hypothetical protein  39.11 
 
 		 273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0997264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6590  hypothetical protein  38.01 
 
 		 273 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1200  hypothetical protein  34.2 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173646  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0349  hypothetical protein  36.67 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.454232 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0785  hypothetical protein  32.33 
 
 		 276 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1079  hypothetical protein  37.55 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0880  hypothetical protein  30.83 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  0.661048 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1990  hypothetical protein  26.67 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.694197  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1879  hypothetical protein  26.67 
 
 		 262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1563  hypothetical protein  35.45 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2403  hypothetical protein  34.08 
 
 		 275 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1161  hypothetical protein  30.89 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0934  hypothetical protein  33.94 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1561  hypothetical protein  29.96 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2870  hypothetical protein  32.88 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167571  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2177  hypothetical protein  33.63 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.425636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0875  hypothetical protein  26.03 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0905  hypothetical protein  26.45 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.704217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0426  hypothetical protein  26.45 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25140  hypothetical protein  31.9 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1889  hypothetical protein  30.2 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.269802  hitchhiker  0.000253515 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6339  hypothetical protein  28.46 
 
 		 245 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.889087  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05227  hypothetical protein  26.45 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4371  hypothetical protein  28.63 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0530948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4817  hypothetical protein  25.62 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.64041 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0251  hypothetical protein  26.82 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6034  hypothetical protein  24.76 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>