More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2040 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 174 aa  360  6e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 		 180 aa  91.3  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.845634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1760  acetyltransferase  34.19 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.319622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0135  acetyltransferase  34.19 
 
 		 184 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1272  acetyltransferase  34.19 
 
 		 184 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.149301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1960  acetyltransferase  34.19 
 
 		 184 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00531041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1787  acetyltransferase  34.19 
 
 		 184 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.600218  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1808  acetyltransferase  34.19 
 
 		 184 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1031  acetyltransferase  34.19 
 
 		 184 aa  89.4  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.462594  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1419  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 180 aa  89  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1537  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 		 180 aa  87.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 		 180 aa  87.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1513  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.667629  hitchhiker  0.000592502 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4677  GCN5-related N-acetyltransferase  33.95 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121511  normal  0.198748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1717  GCN5-related N-acetyltransferase  33.55 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2526  acetyltransferase  32.9 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0308395  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1680  GCN5-related N-acetyltransferase  33.78 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5257  acetyltransferase, putative  26.28 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727946 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1769  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171854  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  26.45 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4127  GCN5-related N-acetyltransferase  27.08 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  28.4 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  28.67 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  28.4 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0233  GCN5-related N-acetyltransferase  26.97 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000113793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  26.11 
 
 		 189 aa  62  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  30.41 
 
 		 189 aa  62  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5650  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  29.17 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  26.17 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4301  GCN5-related N-acetyltransferase  29.58 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0629875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  24.86 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0840  acetyltransferase  25.83 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138744  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0919  hypothetical protein  22.81 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02198  GCN5-related N-acetyltransferase  31.63 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2234  GCN5-related N-acetyltransferase  25.16 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000113859  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4440  GCN5-related N-acetyltransferase  26.38 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  28.48 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2798  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  28.57 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  27.46 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28760  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.13 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  27.74 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  27.85 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2217  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0249063  normal  0.199157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0471  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000161349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2175  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.87 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000924532  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1896  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0485206  normal  0.78893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6386  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725822 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  28.67 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2570  GCN5-related N-acetyltransferase  28.1 
 
 		 192 aa  57.4  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  24.68 
 
 		 396 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1131  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.725869  normal  0.858589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3550  GCN5-related N-acetyltransferase  29.06 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0900  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513382  hitchhiker  0.00121698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2749  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  24.68 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000127055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2873  YnaD  23.81 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  25.32 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1974  hypothetical protein  29.01 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.252487  normal  0.46439 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2452  acetyltransferase  23.23 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000462654  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4417  GCN5-related N-acetyltransferase  24.83 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2946  acetyltransferase, GNAT family  23.23 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000111419  decreased coverage  0.00000000013504 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003301  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4644  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 		 347 aa  55.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.643717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2259  GCN5-related N-acetyltransferase  26.22 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000198313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1341  acetyltransferase  31.08 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6285  GCN5-related N-acetyltransferase  26.92 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2385  acetyltransferase, GNAT family  23.23 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000643226  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2255  acetyltransferase  23.27 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2214  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  23.27 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.09842e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  27.21 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2438  acetyltransferase, GNAT family  23.27 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.144947 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2420  acetyltransferase  23.27 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772154  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2519  acetyltransferase, GNAT family  23.23 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000365018  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  23.43 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000333496  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  24.34 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  26.21 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5418  GCN5-related N-acetyltransferase  28.71 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.192124  normal  0.0663146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2749  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.583104  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0077  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 		 317 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  28 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  25.64 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3045  acetyltransferase, GNAT family  24.03 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.300974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3010  acetyltransferase  24.03 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>