259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1931 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
186 aa  390  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000333496  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1712  GCN5-related N-acetyltransferase  56.15 
 
 
187 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896279  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2374  GCN5-related N-acetyltransferase  51.85 
 
 
193 aa  209  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148578  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0919  hypothetical protein  51.34 
 
 
181 aa  199  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2259  GCN5-related N-acetyltransferase  50.79 
 
 
202 aa  193  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000198313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1974  hypothetical protein  44.85 
 
 
188 aa  167  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.252487  normal  0.46439 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02198  GCN5-related N-acetyltransferase  47.49 
 
 
172 aa  164  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5257  acetyltransferase, putative  39.26 
 
 
200 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  34.68 
 
 
187 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2570  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
192 aa  89  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0983  hypothetical protein  33.51 
 
 
189 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  32.72 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2749  GCN5-related N-acetyltransferase  30.29 
 
 
207 aa  73.2  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.583104  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  31.07 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.29 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  32.22 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0136  hypothetical protein  31.71 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  32.39 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1341  acetyltransferase  32.75 
 
 
186 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  30.98 
 
 
186 aa  62  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
187 aa  61.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  26.7 
 
 
182 aa  61.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  27.54 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
170 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  26.4 
 
 
182 aa  60.1  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  29.78 
 
 
192 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  28.9 
 
 
176 aa  59.3  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  30.49 
 
 
179 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.845634  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1419  GCN5-related N-acetyltransferase  26.99 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1760  acetyltransferase  27.81 
 
 
174 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.319622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1787  acetyltransferase  26.67 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.600218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1272  acetyltransferase  26.67 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.149301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1960  acetyltransferase  26.67 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00531041  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1031  acetyltransferase  26.67 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.462594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1808  acetyltransferase  26.67 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0135  acetyltransferase  26.67 
 
 
184 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2526  acetyltransferase  27.22 
 
 
184 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0308395  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1799  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 
180 aa  58.2  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.873106  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2810  acetyltransferase  28.83 
 
 
188 aa  57.8  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
174 aa  58.2  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  27.75 
 
 
174 aa  57.8  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0412368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  30.82 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4677  GCN5-related N-acetyltransferase  25.77 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121511  normal  0.198748 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1717  GCN5-related N-acetyltransferase  26.67 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  28.32 
 
 
196 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1513  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 
180 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.667629  hitchhiker  0.000592502 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  29.81 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4439  GCN5-related N-acetyltransferase  26.35 
 
 
175 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  29.82 
 
 
185 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1745  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
188 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1537  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 
180 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  29.48 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1894  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
168 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
182 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1666  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
170 aa  55.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
176 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2792  ribosomal protein N-acetylase-like protein  27.22 
 
 
201 aa  54.7  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3294  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 
173 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.911008  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4466  GCN5-related N-acetyltransferase  28.33 
 
 
318 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
183 aa  54.7  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.215241  normal  0.0203096 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0334  acetyltransferase  37.21 
 
 
182 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1801  GCN5-related N-acetyltransferase  28.14 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.427986  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2701  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.190753  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2477  GCN5-related N-acetyltransferase  28.14 
 
 
167 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.362276  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1848  GCN5-related N-acetyltransferase  28.14 
 
 
167 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.905398  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4440  GCN5-related N-acetyltransferase  27.11 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  29.38 
 
 
195 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  28.14 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3219  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.143188  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3624  GCN5-related N-acetyltransferase  26.99 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.436792  normal  0.227566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3398  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 
166 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  27.81 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  27.75 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1680  GCN5-related N-acetyltransferase  28.93 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292432 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  26.74 
 
 
176 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0900  GCN5-related N-acetyltransferase  26.79 
 
 
188 aa  52.4  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513382  hitchhiker  0.00121698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3606  GCN5-related N-acetyltransferase  27.65 
 
 
174 aa  52.4  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  25.13 
 
 
173 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 
184 aa  52.4  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6760  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
178 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2707  acetyltransferase  28.57 
 
 
171 aa  51.6  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2493  GCN5-related N-acetyltransferase  28.92 
 
 
165 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.807404  hitchhiker  0.00667381 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08539  GNAT family acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03650)  27.61 
 
 
202 aa  51.2  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
167 aa  51.6  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  27.98 
 
 
165 aa  51.2  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.251106  normal  0.86295 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  27.39 
 
 
189 aa  51.2  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0318  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
174 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1795  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
166 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.116453  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  28.9 
 
 
177 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2577  GCN5-related N-acetyltransferase  25.54 
 
 
169 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.230542  normal  0.273623 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2642  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.958257  normal  0.277801 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2303  GCN5-related N-acetyltransferase  28.31 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00517346  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05693  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.79 
 
 
169 aa  50.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  26.99 
 
 
171 aa  49.3  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0101732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>