260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1974 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1974  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  391  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.252487  normal  0.46439 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2259  GCN5-related N-acetyltransferase  47.09 
 
 		 202 aa  180  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000198313  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0919  hypothetical protein  42.55 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02198  GCN5-related N-acetyltransferase  50.28 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.367344  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2374  GCN5-related N-acetyltransferase  46.56 
 
 		 193 aa  175  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148578  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1712  GCN5-related N-acetyltransferase  47.42 
 
 		 187 aa  174  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  44.85 
 
 		 186 aa  167  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000333496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5396  hypothetical protein  34.55 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.12309  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5257  acetyltransferase, putative  33.94 
 
 		 200 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.727946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  33.74 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0983  hypothetical protein  34.83 
 
 		 189 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2570  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 		 192 aa  90.5  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345636  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2749  GCN5-related N-acetyltransferase  33.74 
 
 		 207 aa  87.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.583104  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1419  GCN5-related N-acetyltransferase  34.32 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  34.32 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.845634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4677  GCN5-related N-acetyltransferase  33.53 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121511  normal  0.198748 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1513  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.667629  hitchhiker  0.000592502 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1057  GCN5-related N-acetyltransferase  32.34 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1537  GCN5-related N-acetyltransferase  32.34 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05770  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  32.14 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.732888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  28.16 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1717  GCN5-related N-acetyltransferase  32.32 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00372665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1311  GCN5-related N-acetyltransferase  29.76 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3549  GCN5-related N-acetyltransferase  36.65 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1031  acetyltransferase  30.49 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.462594  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1272  acetyltransferase  30.49 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.149301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1787  acetyltransferase  30.49 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.600218  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1960  acetyltransferase  30.49 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00531041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1808  acetyltransferase  30.49 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1760  acetyltransferase  30.18 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.319622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0135  acetyltransferase  30.49 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1069  GCN5-related N-acetyltransferase  32.57 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.321375  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1726  GCN5-related N-acetyltransferase  30.64 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.120192  normal  0.361914 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5041  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 		 181 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0757  GCN5-related N-acetyltransferase  33.54 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.583099  normal  0.483194 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08539  GNAT family acetyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03650)  32.22 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4065  acetyltransferase, GNAT family protein  32.56 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811342  normal  0.114074 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1936  GCN5-related N-acetyltransferase  27.96 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0502  hypothetical protein  29.7 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2526  acetyltransferase  29.94 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0308395  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3711  GNAT family acetyltransferase  28.98 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0749115 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2701  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.190753  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1637  acetyltransferase  29.45 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12840  acetyltransferase  27.33 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.70989 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6663  GCN5-related N-acetyltransferase  31.14 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.705865  decreased coverage  0.00424532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1163  hypothetical protein  27.33 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2013  GCN5-related N-acetyltransferase  30.54 
 
 		 191 aa  62  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3442  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.140269  normal  0.219555 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1660  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000280495  normal  0.382849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4637  GCN5-related N-acetyltransferase  29.07 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00311886  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1680  GCN5-related N-acetyltransferase  28.24 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.292432 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22370  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  29.41 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4466  GCN5-related N-acetyltransferase  30.57 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4661  acetyltransferase, GNAT family  27.91 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2510  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000402264  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4294  histone deacetylase family protein  29.48 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2623  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000174029  normal  0.132453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4917  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2503  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000129781  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1591  GCN5-related N-acetyltransferase  30.06 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00525459  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0657  GCN5-related N-acetyltransferase  29.65 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000154743  normal  0.388985 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  28.05 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000035189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000324552  normal  0.0183454 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  28.05 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4991  GCN5-related N-acetyltransferase  32.72 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0659078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1715  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000065025  normal  0.148419 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.592473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4763  acetyltransferase  29.01 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000011701  decreased coverage  0.000662492 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3816  peptidase S26A, signal peptidase I  29.95 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000746245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  27.44 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.349296  normal  0.801839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3398  GCN5-related N-acetyltransferase  29.71 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1212  hypothetical protein  30.91 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1218  hypothetical protein  30.3 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2320  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3943  GCN5-related N-acetyltransferase  31.35 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000968058  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0926  GCN5-related N-acetyltransferase  28.9 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639831  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2299  GCN5-related N-acetyltransferase  25.14 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1088  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.65463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1666  GCN5-related N-acetyltransferase  28.65 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0840  acetyltransferase  26.47 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0138744  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2264  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2493  GCN5-related N-acetyltransferase  27.62 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.807404  hitchhiker  0.00667381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4775  GCN5-related N-acetyltransferase  27.75 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00110817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2303  GCN5-related N-acetyltransferase  27.62 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00517346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3219  GCN5-related N-acetyltransferase  29.67 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.143188  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2707  acetyltransferase  26.52 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  26.52 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0101732  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  28.66 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 		 174 aa  55.5  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2373  GCN5-related N-acetyltransferase  26.63 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.251106  normal  0.86295 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0113  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2313  GCN5-related N-acetyltransferase  28.8 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1081  GCN5-related N-acetyltransferase  27.12 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0412368 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2047  anhydro-N-acetylmuramic acid kinase  27.67 
 
 		 529 aa  54.7  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.830123  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0373  GCN5-related N-acetyltransferase  28.11 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.970254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>