More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4164 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
287 aa  563  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  88.58 
 
 
288 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  84.15 
 
 
286 aa  477  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  74.38 
 
 
284 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0172478  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  74.73 
 
 
291 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  69.12 
 
 
291 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  68.46 
 
 
285 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  61.85 
 
 
272 aa  329  4e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3289  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.48 
 
 
296 aa  301  9e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3535  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.04 
 
 
275 aa  297  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60.82 
 
 
274 aa  296  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.61 
 
 
298 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.28 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.88 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1135  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.3 
 
 
272 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3008  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.34 
 
 
296 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467458  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2885  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
296 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.08 
 
 
276 aa  275  6e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.99 
 
 
281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.01 
 
 
300 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2758  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.02 
 
 
282 aa  272  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.06 
 
 
281 aa  268  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.06 
 
 
281 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3111  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.66 
 
 
296 aa  267  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0860517  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.86 
 
 
280 aa  265  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.87 
 
 
280 aa  263  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.13 
 
 
287 aa  262  6e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.17 
 
 
266 aa  254  8e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6749  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
282 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.81 
 
 
266 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.84 
 
 
302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.8 
 
 
296 aa  245  6.999999999999999e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0260  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.77 
 
 
292 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.3 
 
 
257 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0232  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.7 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.56 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1580  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.7 
 
 
292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.55 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.93 
 
 
270 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.15 
 
 
279 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.72 
 
 
262 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.18 
 
 
268 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.18 
 
 
268 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.84 
 
 
260 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.63 
 
 
276 aa  229  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.23 
 
 
268 aa  228  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.23 
 
 
268 aa  228  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.86 
 
 
268 aa  228  8e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.07 
 
 
271 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.06 
 
 
291 aa  228  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.01 
 
 
269 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.93 
 
 
271 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.8 
 
 
266 aa  226  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.49 
 
 
268 aa  226  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.1 
 
 
263 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.24 
 
 
269 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.08 
 
 
268 aa  225  7e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.24 
 
 
269 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.94 
 
 
290 aa  224  9e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.6 
 
 
269 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.49 
 
 
265 aa  224  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.88 
 
 
269 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.06 
 
 
283 aa  223  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.61 
 
 
261 aa  222  7e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.82 
 
 
265 aa  222  7e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.62 
 
 
263 aa  222  7e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.04 
 
 
268 aa  221  8e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.21 
 
 
287 aa  221  8e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.93 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000288014  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.04 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.52 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.56 
 
 
260 aa  219  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.96 
 
 
273 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.59 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0680  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.55 
 
 
299 aa  218  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.690592  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.86 
 
 
301 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3602  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.06 
 
 
306 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.189288 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.38 
 
 
301 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321148  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.78 
 
 
267 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3940  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.06 
 
 
306 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.61 
 
 
302 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.863429  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.4 
 
 
298 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0761  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47 
 
 
296 aa  218  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2649  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.58 
 
 
296 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.635632  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1849  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.4 
 
 
296 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.4 
 
 
296 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.3 
 
 
262 aa  217  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.98 
 
 
296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1101  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.49 
 
 
280 aa  216  4e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.61 
 
 
267 aa  215  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.93 
 
 
261 aa  215  5.9999999999999996e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.14 
 
 
296 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.14 
 
 
296 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.14 
 
 
296 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.14 
 
 
296 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.14 
 
 
296 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.14 
 
 
296 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.93 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.98 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.98 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>