More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4842 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
286 aa  560  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  84.15 
 
 
287 aa  477  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  82.87 
 
 
288 aa  470  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  77.66 
 
 
284 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0172478  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  75.35 
 
 
291 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  71.93 
 
 
291 aa  425  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  72.86 
 
 
285 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.26 
 
 
272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3535  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.99 
 
 
275 aa  305  7e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3289  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.27 
 
 
296 aa  299  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.95 
 
 
298 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1135  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60.3 
 
 
272 aa  295  5e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.96 
 
 
274 aa  287  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3008  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.85 
 
 
296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467458  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.84 
 
 
276 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2885  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.19 
 
 
296 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.58 
 
 
300 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.18 
 
 
282 aa  281  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.02 
 
 
281 aa  275  6e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2758  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.68 
 
 
282 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.86 
 
 
280 aa  272  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.07 
 
 
300 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3111  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.85 
 
 
296 aa  270  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0860517  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.56 
 
 
281 aa  268  7e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.56 
 
 
281 aa  268  7e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.48 
 
 
287 aa  265  5e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105737  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6749  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.9 
 
 
282 aa  258  6e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.76 
 
 
280 aa  257  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.64 
 
 
266 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.8 
 
 
302 aa  249  4e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.72 
 
 
266 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.63 
 
 
271 aa  243  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.03 
 
 
301 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.37 
 
 
257 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.85 
 
 
296 aa  236  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0260  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.33 
 
 
292 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.21 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.62 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.67 
 
 
296 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.67 
 
 
269 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1580  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.64 
 
 
292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0232  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.64 
 
 
292 aa  232  5e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.3 
 
 
269 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.3 
 
 
269 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.56 
 
 
279 aa  231  8.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.11 
 
 
261 aa  231  9e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3632  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.25 
 
 
301 aa  231  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.2 
 
 
270 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.49 
 
 
268 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.49 
 
 
268 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.13 
 
 
268 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.05 
 
 
260 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.2 
 
 
270 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.76 
 
 
268 aa  228  7e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.93 
 
 
269 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.96 
 
 
266 aa  228  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43 
 
 
296 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43 
 
 
296 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.1 
 
 
268 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43 
 
 
296 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.52 
 
 
296 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43 
 
 
296 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43 
 
 
296 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.32 
 
 
270 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.52 
 
 
296 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43 
 
 
296 aa  226  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.1 
 
 
268 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.44 
 
 
298 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43 
 
 
296 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0784627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.37 
 
 
261 aa  226  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000288014  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.13 
 
 
271 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1849  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.1 
 
 
296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.1 
 
 
296 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5791  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.75 
 
 
296 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.58 
 
 
291 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.05 
 
 
301 aa  223  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321148  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1101  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.3 
 
 
280 aa  223  2e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.44 
 
 
268 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.52 
 
 
267 aa  223  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.04 
 
 
265 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.12 
 
 
263 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0680  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.99 
 
 
299 aa  223  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.690592  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.1 
 
 
269 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.58 
 
 
271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.11 
 
 
283 aa  222  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.59 
 
 
276 aa  222  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.72 
 
 
260 aa  221  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.19 
 
 
262 aa  221  8e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.74 
 
 
268 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2649  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.18 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.635632  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.15 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.83 
 
 
263 aa  220  3e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.15 
 
 
287 aa  219  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.87 
 
 
273 aa  219  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.17 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.76 
 
 
290 aa  218  8.999999999999998e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.66 
 
 
267 aa  217  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.19 
 
 
265 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.8 
 
 
256 aa  215  5e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.32 
 
 
264 aa  216  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>