More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2948 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
263 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  78.57 
 
 
265 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  66.67 
 
 
285 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  63.12 
 
 
267 aa  328  8e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  61.51 
 
 
266 aa  325  6e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  61.51 
 
 
266 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  64.96 
 
 
270 aa  323  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  63.86 
 
 
265 aa  317  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60.47 
 
 
266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60 
 
 
271 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.61 
 
 
269 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.27 
 
 
261 aa  305  4.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.82 
 
 
268 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.82 
 
 
268 aa  305  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.87 
 
 
261 aa  304  8.000000000000001e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.68 
 
 
262 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.13 
 
 
270 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.13 
 
 
270 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.43 
 
 
268 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60.87 
 
 
262 aa  302  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0592  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  63.31 
 
 
280 aa  300  2e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801291  unclonable  2.22313e-18 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.57 
 
 
283 aa  297  1e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.38 
 
 
256 aa  291  5e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  61.9 
 
 
275 aa  291  7e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.79 
 
 
265 aa  290  2e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.58 
 
 
256 aa  289  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.78 
 
 
273 aa  288  7e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.18 
 
 
273 aa  288  9e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.37 
 
 
271 aa  286  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.69 
 
 
269 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.97 
 
 
267 aa  285  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1415  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.43 
 
 
248 aa  281  6.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.09 
 
 
270 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.54 
 
 
271 aa  280  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.28 
 
 
276 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.31 
 
 
267 aa  276  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04650  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.55 
 
 
296 aa  276  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0706142  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.31 
 
 
271 aa  275  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.93 
 
 
268 aa  272  3e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.56 
 
 
268 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.56 
 
 
268 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.93 
 
 
268 aa  271  9e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.57 
 
 
290 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.46 
 
 
269 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.62 
 
 
268 aa  270  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.46 
 
 
269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.08 
 
 
269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0571  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.69 
 
 
266 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.76 
 
 
261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.08 
 
 
269 aa  268  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.51 
 
 
289 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.01 
 
 
268 aa  266  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0661  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.07 
 
 
295 aa  266  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54 
 
 
260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.23 
 
 
287 aa  261  8.999999999999999e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.64 
 
 
261 aa  260  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.11 
 
 
280 aa  259  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.85 
 
 
282 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.64 
 
 
290 aa  258  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.64 
 
 
290 aa  258  7e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.64 
 
 
290 aa  258  7e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.83 
 
 
296 aa  258  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.45 
 
 
290 aa  258  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
296 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0784627  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
296 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
296 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
296 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
296 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
296 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
296 aa  257  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.16 
 
 
301 aa  256  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321148  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.19 
 
 
280 aa  257  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.33 
 
 
257 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.45 
 
 
287 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.94 
 
 
257 aa  255  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.45 
 
 
287 aa  255  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.83 
 
 
300 aa  255  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.64 
 
 
287 aa  254  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105737  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.49 
 
 
300 aa  254  9e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2410  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.32 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5791  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1450  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
301 aa  251  8.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.35 
 
 
296 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
301 aa  251  9.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.642612  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.35 
 
 
296 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2273  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.32 
 
 
269 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2758  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.47 
 
 
282 aa  250  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.59 
 
 
301 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.2 
 
 
260 aa  249  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.3 
 
 
298 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3397  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.35 
 
 
289 aa  249  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1849  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.3 
 
 
296 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.3 
 
 
296 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.97 
 
 
264 aa  249  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.59 
 
 
263 aa  248  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.05 
 
 
272 aa  248  8e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0906  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.35 
 
 
289 aa  248  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.89 
 
 
291 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.115465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4094  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.89 
 
 
291 aa  248  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00562509  normal  0.0603079 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3229  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.44 
 
 
291 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228705 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>