More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5413 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
300 aa  586  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2885  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  81.23 
 
 
296 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3008  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  80.2 
 
 
296 aa  473  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467458  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3111  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  80.89 
 
 
296 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0860517  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3289  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  75.6 
 
 
296 aa  421  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  73.4 
 
 
298 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.55 
 
 
272 aa  296  4e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.88 
 
 
291 aa  294  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.77 
 
 
291 aa  293  3e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.53 
 
 
287 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.72 
 
 
286 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.34 
 
 
284 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0172478  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3535  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.93 
 
 
275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.85 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.06 
 
 
282 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.7 
 
 
285 aa  280  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.84 
 
 
288 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2758  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.48 
 
 
282 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.31 
 
 
287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105737  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.29 
 
 
274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.54 
 
 
300 aa  271  8.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.41 
 
 
276 aa  267  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.57 
 
 
281 aa  265  8.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.57 
 
 
281 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.57 
 
 
281 aa  261  1e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6749  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.4 
 
 
282 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1135  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.38 
 
 
272 aa  250  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.48 
 
 
280 aa  249  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.26 
 
 
266 aa  234  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.89 
 
 
266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.48 
 
 
263 aa  232  5e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.2 
 
 
285 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.56 
 
 
257 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.34 
 
 
265 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.14 
 
 
265 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.15 
 
 
257 aa  222  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.41 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.81 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.67 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.45 
 
 
266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.86 
 
 
270 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.64 
 
 
268 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.64 
 
 
268 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.86 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.8 
 
 
262 aa  216  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.29 
 
 
268 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.46 
 
 
266 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.43 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.38 
 
 
271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.37 
 
 
296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1101  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.44 
 
 
280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.65 
 
 
260 aa  212  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.88 
 
 
267 aa  211  9e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.06 
 
 
268 aa  211  9e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.71 
 
 
268 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.06 
 
 
268 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.06 
 
 
268 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.51 
 
 
273 aa  211  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.24 
 
 
273 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.88 
 
 
291 aa  210  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.64 
 
 
302 aa  209  4e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.863429  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.06 
 
 
279 aa  209  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.73 
 
 
271 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.55 
 
 
260 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.22 
 
 
302 aa  208  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0761  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.26 
 
 
296 aa  208  8e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0994  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.81 
 
 
285 aa  207  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.101042  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.69 
 
 
283 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.6 
 
 
275 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0680  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.91 
 
 
299 aa  206  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.690592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.83 
 
 
267 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.76 
 
 
287 aa  205  6e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.61 
 
 
269 aa  205  8e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.16 
 
 
268 aa  205  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.77 
 
 
269 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.93 
 
 
290 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.77 
 
 
269 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.77 
 
 
269 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1227  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.36 
 
 
261 aa  202  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0136152 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3215  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.6 
 
 
291 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.023751 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3329  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.6 
 
 
291 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3149  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.6 
 
 
291 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69155  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.97 
 
 
267 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.4 
 
 
291 aa  201  9e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00174418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0863  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.4 
 
 
291 aa  201  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00349665  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3034  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.4 
 
 
291 aa  201  9e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0527385  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02637  hypothetical protein  39.4 
 
 
291 aa  201  9e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2975  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.4 
 
 
291 aa  201  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00678242  normal  0.0109979 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4094  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.4 
 
 
291 aa  201  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00562509  normal  0.0603079 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.4 
 
 
291 aa  201  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.115465  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3148  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.4 
 
 
291 aa  201  9e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000698602  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0887  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.4 
 
 
291 aa  201  9e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1415  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.25 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.06 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2534  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.3 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1580  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.16 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3602  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.42 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.189288 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3940  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.42 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0260  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.26 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0232  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.16 
 
 
292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>