More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1231 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
279 aa  560  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60.81 
 
 
291 aa  330  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0680  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.01 
 
 
299 aa  317  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.690592  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.67 
 
 
282 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2758  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.79 
 
 
282 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.43 
 
 
272 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.96 
 
 
285 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.38 
 
 
274 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.13 
 
 
266 aa  239  5e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.31 
 
 
276 aa  236  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.91 
 
 
288 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.39 
 
 
291 aa  235  5.0000000000000005e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.73 
 
 
291 aa  235  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.81 
 
 
280 aa  235  8e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.33 
 
 
287 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105737  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3535  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.15 
 
 
275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.15 
 
 
287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.56 
 
 
286 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1101  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.15 
 
 
280 aa  231  1e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.9 
 
 
262 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1580  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.13 
 
 
292 aa  229  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0232  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.13 
 
 
292 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0260  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.74 
 
 
292 aa  228  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1135  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.7 
 
 
272 aa  228  7e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.67 
 
 
263 aa  228  9e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.69 
 
 
262 aa  227  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.28 
 
 
302 aa  226  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.863429  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.44 
 
 
280 aa  227  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.98 
 
 
270 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.98 
 
 
270 aa  225  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.06 
 
 
265 aa  224  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.1 
 
 
271 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.13 
 
 
268 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.13 
 
 
268 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1492  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.56 
 
 
277 aa  223  3e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.08 
 
 
273 aa  223  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.77 
 
 
276 aa  222  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.96 
 
 
298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.36 
 
 
269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.13 
 
 
264 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.06 
 
 
276 aa  222  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.08 
 
 
271 aa  221  7e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.48 
 
 
267 aa  221  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.99 
 
 
284 aa  221  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0172478  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.79 
 
 
270 aa  221  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.77 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.64 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.53 
 
 
273 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0761  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.16 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.91 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.91 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3289  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.96 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.84 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.22 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.13 
 
 
270 aa  220  3e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.59 
 
 
271 aa  219  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.36 
 
 
268 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.16 
 
 
263 aa  219  5e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.24 
 
 
285 aa  218  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.88 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.04 
 
 
302 aa  215  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.31 
 
 
266 aa  215  7e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.35 
 
 
265 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2874  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.53 
 
 
271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.78 
 
 
290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.58 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.58 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.27 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1923  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.78 
 
 
275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.69 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.69 
 
 
296 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2087  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.84 
 
 
276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228254  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2534  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.96 
 
 
271 aa  212  7e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.07 
 
 
287 aa  211  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2885  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.52 
 
 
296 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.67 
 
 
287 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.24 
 
 
281 aa  210  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.24 
 
 
281 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.25 
 
 
265 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3008  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.52 
 
 
296 aa  209  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467458  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.1 
 
 
261 aa  209  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.08 
 
 
287 aa  209  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.79 
 
 
301 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2731  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.93 
 
 
283 aa  208  7e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0906  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.93 
 
 
289 aa  208  7e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.18 
 
 
263 aa  208  8e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.06 
 
 
300 aa  208  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.74 
 
 
268 aa  208  8e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.42 
 
 
262 aa  208  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.79 
 
 
269 aa  207  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.57 
 
 
290 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.12 
 
 
269 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3940  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.61 
 
 
306 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.12 
 
 
269 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3602  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.61 
 
 
306 aa  207  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.189288 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.12 
 
 
269 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.36 
 
 
260 aa  206  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.81 
 
 
296 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.28 
 
 
268 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>