More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3171 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
287 aa  570  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105737  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  70.11 
 
 
282 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2758  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  70.46 
 
 
282 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  67.16 
 
 
280 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.04 
 
 
281 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.56 
 
 
300 aa  315  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59 
 
 
281 aa  308  6.999999999999999e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59 
 
 
281 aa  308  6.999999999999999e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.48 
 
 
291 aa  291  8e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.29 
 
 
291 aa  289  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.01 
 
 
276 aa  288  5.0000000000000004e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.16 
 
 
288 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2885  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.19 
 
 
296 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.86 
 
 
272 aa  285  5e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56 
 
 
285 aa  285  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.31 
 
 
300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3008  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.85 
 
 
296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467458  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.76 
 
 
284 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0172478  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3289  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.33 
 
 
296 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.14 
 
 
298 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.48 
 
 
286 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3111  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.84 
 
 
296 aa  275  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0860517  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.13 
 
 
287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3535  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.56 
 
 
275 aa  267  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.05 
 
 
263 aa  265  7e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6749  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.73 
 
 
282 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.67 
 
 
265 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.19 
 
 
266 aa  257  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.75 
 
 
266 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50 
 
 
271 aa  256  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1135  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.39 
 
 
272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.12 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.7 
 
 
270 aa  252  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.06 
 
 
270 aa  251  7e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.78 
 
 
283 aa  249  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.08 
 
 
265 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.79 
 
 
269 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.52 
 
 
271 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0994  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.55 
 
 
285 aa  245  8e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.101042  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.14 
 
 
268 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.14 
 
 
268 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.26 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.44 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.21 
 
 
268 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.65 
 
 
266 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.33 
 
 
279 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.32 
 
 
273 aa  242  6e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.61 
 
 
280 aa  241  1e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1415  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.39 
 
 
248 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.94 
 
 
257 aa  240  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.58 
 
 
285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.04 
 
 
256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.86 
 
 
273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.64 
 
 
261 aa  239  4e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.66 
 
 
256 aa  238  8e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.51 
 
 
271 aa  237  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.27 
 
 
260 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.29 
 
 
262 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.27 
 
 
275 aa  237  2e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.99 
 
 
302 aa  236  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0260  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.02 
 
 
292 aa  235  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1101  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.18 
 
 
280 aa  235  7e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.55 
 
 
266 aa  234  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.08 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0571  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.25 
 
 
266 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.09 
 
 
270 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.97 
 
 
290 aa  230  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.77 
 
 
261 aa  230  2e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.9 
 
 
265 aa  228  9e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.94 
 
 
261 aa  228  9e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.33 
 
 
269 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.94 
 
 
261 aa  227  1e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.97 
 
 
302 aa  227  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.863429  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.82 
 
 
267 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.38 
 
 
268 aa  226  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0761  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.61 
 
 
296 aa  226  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0592  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.6 
 
 
280 aa  225  6e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801291  unclonable  2.22313e-18 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.85 
 
 
267 aa  225  7e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.48 
 
 
263 aa  225  8e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.99 
 
 
260 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45 
 
 
269 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.64 
 
 
269 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.28 
 
 
291 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.96 
 
 
268 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.96 
 
 
268 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.96 
 
 
268 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.64 
 
 
269 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2273  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.6 
 
 
269 aa  223  2e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1580  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.64 
 
 
292 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0232  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.64 
 
 
292 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.16 
 
 
268 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.76 
 
 
287 aa  223  4e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.2 
 
 
271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.29 
 
 
269 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.59 
 
 
268 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.24 
 
 
290 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.24 
 
 
290 aa  219  3e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.24 
 
 
290 aa  219  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.71 
 
 
287 aa  216  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.1 
 
 
261 aa  216  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>