More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1135 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1135  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
272 aa  523  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00836355 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3535  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  69.7 
 
 
275 aa  355  3.9999999999999996e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.48 
 
 
291 aa  321  8e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60.3 
 
 
286 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.48 
 
 
291 aa  318  5e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.4 
 
 
272 aa  315  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.3 
 
 
288 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.3 
 
 
287 aa  310  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.55 
 
 
285 aa  310  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.88 
 
 
284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0172478  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2885  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.13 
 
 
296 aa  290  2e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.23 
 
 
298 aa  289  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3289  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.25 
 
 
296 aa  289  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3008  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.39 
 
 
296 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467458  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.34 
 
 
276 aa  283  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.38 
 
 
300 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3111  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.76 
 
 
296 aa  278  9e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0860517  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.47 
 
 
287 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105737  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.24 
 
 
282 aa  274  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6749  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.77 
 
 
282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.61 
 
 
274 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2758  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.51 
 
 
282 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.71 
 
 
280 aa  265  5.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.4 
 
 
280 aa  259  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.34 
 
 
271 aa  258  7e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.08 
 
 
279 aa  256  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.92 
 
 
300 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.08 
 
 
281 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.18 
 
 
276 aa  247  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.61 
 
 
281 aa  246  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.61 
 
 
281 aa  246  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.96 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.08 
 
 
270 aa  241  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.95 
 
 
302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.96 
 
 
296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.48 
 
 
267 aa  237  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.47 
 
 
290 aa  237  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1877  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.52 
 
 
261 aa  236  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000288014  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.94 
 
 
266 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.57 
 
 
266 aa  235  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.67 
 
 
257 aa  234  8e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.05 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.57 
 
 
266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.39 
 
 
289 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2649  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.97 
 
 
296 aa  232  6e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.635632  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.62 
 
 
275 aa  232  6e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.81 
 
 
265 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.63 
 
 
267 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.44 
 
 
262 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.53 
 
 
271 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12220  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.48 
 
 
281 aa  230  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000110554  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.49 
 
 
260 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0260  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.04 
 
 
292 aa  229  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.09 
 
 
276 aa  228  9e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.44 
 
 
271 aa  227  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.73 
 
 
265 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.82 
 
 
260 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.41 
 
 
270 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.21 
 
 
273 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.41 
 
 
270 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.19 
 
 
256 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.56 
 
 
285 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.44 
 
 
262 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2410  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.81 
 
 
303 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.43 
 
 
263 aa  225  6e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.21 
 
 
273 aa  225  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.52 
 
 
270 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.07 
 
 
296 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.07 
 
 
296 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.15 
 
 
287 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.72 
 
 
268 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.8 
 
 
256 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.72 
 
 
266 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.72 
 
 
268 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.67 
 
 
291 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0571  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.49 
 
 
266 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.97 
 
 
264 aa  223  3e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.35 
 
 
268 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.38 
 
 
296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.38 
 
 
296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.38 
 
 
296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.38 
 
 
296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.38 
 
 
296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.38 
 
 
296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1580  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.99 
 
 
292 aa  222  6e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.39 
 
 
261 aa  222  6e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0232  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.99 
 
 
292 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.38 
 
 
296 aa  221  9e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0784627  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.91 
 
 
283 aa  221  9e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.48 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.09 
 
 
261 aa  221  9.999999999999999e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5791  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.42 
 
 
296 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.37 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.96 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.73 
 
 
261 aa  219  3e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.35 
 
 
269 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.48 
 
 
300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.14 
 
 
300 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.932329  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1849  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.05 
 
 
296 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.05 
 
 
296 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>