More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2727 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
262 aa  517  1e-146  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60.69 
 
 
266 aa  338  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60.69 
 
 
266 aa  338  5e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  64.77 
 
 
270 aa  337  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  63.08 
 
 
265 aa  335  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60.08 
 
 
268 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0592  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  66.67 
 
 
280 aa  325  5e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801291  unclonable  2.22313e-18 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  62.21 
 
 
265 aa  324  8.000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60.08 
 
 
268 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60.08 
 
 
268 aa  323  1e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60.54 
 
 
266 aa  323  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  61.3 
 
 
262 aa  323  1e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.87 
 
 
270 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.49 
 
 
270 aa  322  3e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.94 
 
 
269 aa  321  7e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.16 
 
 
271 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  62.74 
 
 
271 aa  317  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.54 
 
 
261 aa  311  7.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.75 
 
 
269 aa  308  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.24 
 
 
261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1415  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  62.15 
 
 
248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  58.24 
 
 
261 aa  306  3e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.68 
 
 
263 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60 
 
 
275 aa  303  1.0000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  59.77 
 
 
267 aa  298  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000193286  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60.47 
 
 
265 aa  298  7e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.47 
 
 
256 aa  296  2e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.36 
 
 
273 aa  293  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.69 
 
 
256 aa  291  7e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.09 
 
 
267 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.21 
 
 
283 aa  286  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.65 
 
 
273 aa  285  5e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.65 
 
 
267 aa  285  5e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.2 
 
 
271 aa  285  5.999999999999999e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.88 
 
 
268 aa  281  9e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56 
 
 
285 aa  278  7e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.7 
 
 
268 aa  277  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.61 
 
 
301 aa  276  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.642612  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04650  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.96 
 
 
296 aa  276  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0706142  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1450  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.61 
 
 
301 aa  276  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.94 
 
 
268 aa  275  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.56 
 
 
268 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  55.56 
 
 
268 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.32 
 
 
268 aa  275  8e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0703  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.47 
 
 
294 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.609213 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.96 
 
 
269 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.33 
 
 
269 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1342  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.12 
 
 
294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.96 
 
 
269 aa  268  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0348  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.15 
 
 
289 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.96 
 
 
269 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2010  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.07 
 
 
294 aa  268  8e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0661  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.82 
 
 
295 aa  268  8.999999999999999e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.41 
 
 
276 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0571  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.85 
 
 
266 aa  267  1e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.44 
 
 
270 aa  265  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2330  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.31 
 
 
292 aa  265  5.999999999999999e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.486837 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0349  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  56.3 
 
 
274 aa  263  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.932967  normal  0.231861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.53 
 
 
290 aa  262  4.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2313  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.12 
 
 
294 aa  261  8.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.65 
 
 
287 aa  260  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.14 
 
 
263 aa  260  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.47 
 
 
290 aa  259  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.76 
 
 
261 aa  259  3e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.7 
 
 
287 aa  258  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.47 
 
 
290 aa  258  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.47 
 
 
290 aa  258  9e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.47 
 
 
290 aa  258  9e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0906  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.11 
 
 
289 aa  257  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.61 
 
 
271 aa  257  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.47 
 
 
287 aa  256  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3397  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.41 
 
 
289 aa  255  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.57 
 
 
291 aa  255  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00174418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0863  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.57 
 
 
291 aa  255  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00349665  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.57 
 
 
291 aa  255  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.115465  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4094  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.57 
 
 
291 aa  255  5e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00562509  normal  0.0603079 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02637  hypothetical protein  48.57 
 
 
291 aa  255  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3148  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.57 
 
 
291 aa  255  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000698602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2975  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.57 
 
 
291 aa  255  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00678242  normal  0.0109979 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0887  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.57 
 
 
291 aa  255  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3034  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.57 
 
 
291 aa  255  5e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0527385  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.62 
 
 
266 aa  254  8e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3843  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  53.99 
 
 
280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.944466  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3229  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.11 
 
 
291 aa  252  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228705 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3166  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.11 
 
 
291 aa  252  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0961486  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.55 
 
 
280 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3329  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.11 
 
 
291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00985131 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3149  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.11 
 
 
291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.69155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3215  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.11 
 
 
291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.023751 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.33 
 
 
270 aa  251  6e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3270  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.93 
 
 
290 aa  250  2e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0375985  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.97 
 
 
264 aa  249  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.63 
 
 
272 aa  248  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.07 
 
 
281 aa  248  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.58 
 
 
281 aa  246  2e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.46 
 
 
260 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.58 
 
 
281 aa  246  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.11 
 
 
296 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.11 
 
 
296 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.02 
 
 
257 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>