More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0488 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
291 aa  583  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  60.81 
 
 
279 aa  330  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0680  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.01 
 
 
299 aa  276  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.690592  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  51.2 
 
 
285 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.2 
 
 
263 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.24 
 
 
265 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.7 
 
 
282 aa  238  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.32 
 
 
280 aa  235  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2758  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.06 
 
 
282 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.84 
 
 
285 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  52.16 
 
 
274 aa  232  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1101  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.53 
 
 
280 aa  228  8e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.06 
 
 
287 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.22 
 
 
288 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.83 
 
 
291 aa  228  1e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4214  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.63 
 
 
266 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.61 
 
 
272 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.22 
 
 
302 aa  225  8e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.863429  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.58 
 
 
286 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.97 
 
 
269 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.28 
 
 
271 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_002978  WD0768  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.35 
 
 
263 aa  224  2e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.2 
 
 
267 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.69 
 
 
269 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.36 
 
 
266 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.74 
 
 
266 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2727  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.48 
 
 
262 aa  223  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0904003  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.2 
 
 
280 aa  222  4e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.98 
 
 
271 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.15 
 
 
269 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0233  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.84 
 
 
270 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.15 
 
 
269 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.48 
 
 
268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.65 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0232  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.67 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48 
 
 
276 aa  219  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0260  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.3 
 
 
292 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1580  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.32 
 
 
292 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2746  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.1 
 
 
265 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.33 
 
 
281 aa  219  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.57 
 
 
273 aa  218  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.49 
 
 
273 aa  218  7e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48180  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.95 
 
 
265 aa  218  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.49 
 
 
276 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.61 
 
 
281 aa  217  1e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.61 
 
 
281 aa  217  1e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.8 
 
 
261 aa  218  1e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.42 
 
 
291 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1698  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.82 
 
 
266 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000567119  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.28 
 
 
287 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105737  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.98 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.7 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.7 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.7 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0761  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.83 
 
 
296 aa  215  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2042  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.87 
 
 
260 aa  215  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000269177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2433  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.1 
 
 
262 aa  215  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.56 
 
 
260 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5195  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.94 
 
 
268 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5049  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.94 
 
 
268 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5283  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.59 
 
 
270 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1145  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.89 
 
 
268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.39 
 
 
300 aa  212  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3289  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.68 
 
 
296 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3535  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.06 
 
 
275 aa  212  7e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.12 
 
 
263 aa  212  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.5 
 
 
284 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0172478  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4841  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.23 
 
 
270 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0674  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.8 
 
 
302 aa  211  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0323  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.8 
 
 
269 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.337894  normal  0.658901 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0543  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.83 
 
 
285 aa  210  2e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5374  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.8 
 
 
271 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  40.29 
 
 
290 aa  209  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.75 
 
 
296 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.35 
 
 
270 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04650  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.88 
 
 
296 aa  209  6e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0706142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.75 
 
 
257 aa  208  7e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2928  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.64 
 
 
256 aa  207  1e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.49 
 
 
298 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.21 
 
 
257 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5142  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.8 
 
 
268 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0470002  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.25 
 
 
275 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1733  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.58 
 
 
261 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.44 
 
 
268 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.78 
 
 
287 aa  206  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2782  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.69 
 
 
256 aa  206  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0440  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.58 
 
 
261 aa  206  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.541789  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3397  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.18 
 
 
289 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.93 
 
 
300 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0592  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.11 
 
 
280 aa  205  7e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000801291  unclonable  2.22313e-18 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0906  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  39.12 
 
 
289 aa  205  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3239  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.62 
 
 
290 aa  205  9e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.132712  normal  0.305063 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0983  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.62 
 
 
290 aa  205  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000100522  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1035  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  38.62 
 
 
290 aa  205  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.849889  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2573  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.7 
 
 
267 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0505  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.58 
 
 
287 aa  202  4e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1903  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.31 
 
 
271 aa  202  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  37.76 
 
 
287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2874  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.4 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.421405 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3008  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.4 
 
 
296 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467458  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>