More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0680 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0680  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  100 
 
 
299 aa  592  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.690592  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  57.6 
 
 
279 aa  325  4.0000000000000003e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288361  normal  0.186488 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0488  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  54.01 
 
 
291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2548  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.43 
 
 
272 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.535661  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.75 
 
 
274 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.462482  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3021  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.43 
 
 
282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4842  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.99 
 
 
286 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3535  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.87 
 
 
275 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.138505  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2758  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  50.57 
 
 
282 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4164  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.55 
 
 
287 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3875  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.77 
 
 
288 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.102914  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1765  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.17 
 
 
285 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.13 
 
 
284 aa  225  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0172478  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1093  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.38 
 
 
280 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.153976  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2504  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.02 
 
 
291 aa  223  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  0.496408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3095  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.83 
 
 
291 aa  223  4e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3015  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.84 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2252  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.06 
 
 
280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.936253  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0620  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.44 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.863429  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3289  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.49 
 
 
296 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655486  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5253  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.69 
 
 
298 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0572  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.45 
 
 
283 aa  216  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0260  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.72 
 
 
292 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.632197 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004428  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.39 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3171  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.41 
 
 
287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105737  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2262  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.15 
 
 
276 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5413  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.62 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2948  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.2 
 
 
263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.622382  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00970  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.59 
 
 
273 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0206  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.99 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1880  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.16 
 
 
271 aa  211  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0668134  normal  0.877518 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3196  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.01 
 
 
287 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0499  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.8 
 
 
285 aa  210  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.686032  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2862  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.33 
 
 
268 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.107443  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2944  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.33 
 
 
268 aa  210  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00576066  normal  0.798295 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3040  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.33 
 
 
268 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.600526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2213  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.98 
 
 
296 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.717518  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2885  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.29 
 
 
296 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.876746  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1231  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.9 
 
 
269 aa  209  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270014  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03707  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.17 
 
 
267 aa  209  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2377  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.52 
 
 
296 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2509  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.52 
 
 
296 aa  209  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1264  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.9 
 
 
269 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.327178  normal  0.379558 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0906  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.05 
 
 
289 aa  209  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.705572  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3126  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.9 
 
 
269 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.178661  normal  0.438843 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0761  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.24 
 
 
296 aa  209  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1389  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  49.41 
 
 
264 aa  208  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1583  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.58 
 
 
257 aa  208  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.889628 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0641  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.2 
 
 
276 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2219  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.58 
 
 
301 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.321148  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1580  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.66 
 
 
292 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0829  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.45 
 
 
296 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2534  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.45 
 
 
271 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1187  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.48 
 
 
269 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0797242  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1644  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.45 
 
 
296 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2332  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.45 
 
 
296 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0115318  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1334  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.5 
 
 
268 aa  207  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2954  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.45 
 
 
296 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0107678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0232  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.66 
 
 
292 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0679  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.45 
 
 
296 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1030  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.45 
 
 
296 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1182  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.45 
 
 
296 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.619166  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1492  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.48 
 
 
277 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2802  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.1 
 
 
270 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3397  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.14 
 
 
289 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0216761  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0990  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.46 
 
 
301 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.910285  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5791  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.82 
 
 
296 aa  206  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1023  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.64 
 
 
296 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0784627  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2651  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.77 
 
 
257 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1639  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.29 
 
 
281 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2039  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.54 
 
 
261 aa  206  6e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0902  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.07 
 
 
275 aa  204  1e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0301  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.36 
 
 
263 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000153612  normal  0.153918 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1849  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.46 
 
 
296 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.46 
 
 
296 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2465  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.46 
 
 
298 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.95 
 
 
260 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0339  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.13 
 
 
261 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0425  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46 
 
 
276 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0866  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  46.72 
 
 
268 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.13181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3008  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  42.86 
 
 
296 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.467458  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1528  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.08 
 
 
281 aa  202  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1477  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  47.08 
 
 
281 aa  202  4e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0180455  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2131  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.1 
 
 
265 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2150  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  44.19 
 
 
300 aa  202  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2731  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  48.11 
 
 
283 aa  201  9e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3822  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.43 
 
 
290 aa  201  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00839067  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1923  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.17 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0434  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.61 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0921151  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02676  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.43 
 
 
291 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00174418  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0863  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.43 
 
 
291 aa  200  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00349665  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0887  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.43 
 
 
291 aa  200  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4094  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.43 
 
 
291 aa  200  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00562509  normal  0.0603079 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2974  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.43 
 
 
291 aa  200  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.115465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2975  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.43 
 
 
291 aa  200  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00678242  normal  0.0109979 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3034  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.43 
 
 
291 aa  200  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0527385  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3148  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  41.43 
 
 
291 aa  200  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000698602  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04460  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  43.61 
 
 
266 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02637  hypothetical protein  41.43 
 
 
291 aa  200  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00123723  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3622  prolipoprotein diacylglyceryl transferase  45.82 
 
 
290 aa  199  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>